Geeni
SYT2
synaptotagmin 2
- HGNC 11510↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000143858↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 127833↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q32.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 202 590 596–202 710 454 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 119,9 kb:n alueella
- Proteiini
- 419 aminohappoa
- MANE Select -transkripti
- ENST00000367268.5NM_177402.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SYT2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Synnynnäinen myasteeninen oireyhtymä
- Synnynnäinen myasteeninen oireyhtymä (kaikki tyypit)
Yläkäsite, joka kattaa kaikki synnynnäiset myasteeniset oireyhtymät, mukaan lukien yleiset CHRNE-, RAPSN-, DOK7- ja MUSK-muodot.
- ClinGen luokittelee yhteyden: kohtalainen
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Monet muodot reagoivat tiettyihin lääkkeisiin, kuten pyridostigmiiniin, salbutamoliin tai efedriiniin, ja sopiva valinta riippuu kyseessä olevasta geenistä.
SYT2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 7,6 kb geenin 119,9 kb:stä; 1 260 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SYT2
6
SYT2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 119,9 kb geenistä SYT2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 7,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AGRNagrinYhteinen sairaus: 1
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitYhteinen sairaus: 1
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- CHATcholine O-acetyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- CHRNA1cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunitYhteinen sairaus: 1
- CHRNB1cholinergic receptor nicotinic beta 1 subunitYhteinen sairaus: 1
- CHRNDcholinergic receptor nicotinic delta subunitYhteinen sairaus: 1
- CHRNEcholinergic receptor nicotinic epsilon subunitYhteinen sairaus: 1
- COL13A1collagen type XIII alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COLQcollagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesteraseYhteinen sairaus: 1
- DOK7docking protein 7Yhteinen sairaus: 1
- DPAGT1dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin SYT2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SYT2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Absent reflexes
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Compound muscle action potential amplitude facilitation
- Waddling gait
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decreased sensation in extremities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Distal muscle wasting
- EMG: decremental response of compound muscle action potential to repetitive nerve stimulation
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Scoliosis
- Tired easily
- Weakness of outermost muscles
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SYT2-geeni: synaptotagmin 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/syt2
Dante Labs. SYT2-geeni: synaptotagmin 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/syt2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa