Gen
B4GALT1
beta-1,4-galactosyltransferase 1
- HGNC 924↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000086062↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 2683↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 9p21.1
- Souřadnice
- Chromozom 9: 33 110 642–33 167 336 (GRCh38)
- Exony
- 6 exonů na 56,7 kb
- Protein
- 398 aminokyselin
- Další názvy
- beta4Gal-T1
- Předchozí symboly
- GGTB2
- Transkript MANE Select
- ENST00000379731.5NM_001497.4
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/b4galt1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si B4GALT1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Congenital Disorders of Glycosylation
- Congenital Disorders of Glycosylation (CDG)
Jeden z 98 genů spojených s touto vazbou
A large group of inherited conditions in which sugar chains (glycans) are not correctly built or attached to proteins and lipids, often affecting the brain, liver, blood clotting, growth and many other body systems. Most are autosomal recessive, but some are X-linked or autosomal dominant.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 4 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je B4GALT1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,2 kb z 56,7 kb genu; 1 197 těchto bází kódují protein.
Sekvenování B4GALT1
2Snadné
Jak obtížné je sekvenovat B4GALT1 krátkými čteními, ze 100
0 · Snadné100 · Obtížné
Téměř všechny exony genu B4GALT1 leží v místech, kde se krátká čtení spolehlivě mapují.
Co k tomu přispívá: podíl exonů genu B4GALT1 v jednotlivých typech obtížných oblastí
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, se shodou 90 % nebo více. Váha 30 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a úseky jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesně pokrýt. Váha 15 %.3,9 %
- Obsah GCOkna s méně než 25 % nebo více než 65 % G a C, která příprava knihovny pokrývá slabě. Váha 10 %.14 %
- Pokrytí referenčního genomuMezery v referenční sestavě v okolí, kde není sekvence, na kterou by se čtení mohla zarovnat. Váha 10 %.0 %
Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, založené na mapách obtížně sekvenovatelných oblastí Genome in a Bottle od NIST.Jak se skóre počítáKaždý sloupec udává podíl bází exonů genu B4GALT1 v daném typu obtížné oblasti. Jeden typ může gen sám o sobě učinit obtížným a každý další přidá méně: 0, pokud žádná báze není v žádném typu, 100, pokud je každá báze tam, kde nelze čtení jednoznačně umístit.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Sdílí 1 onemocnění
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s B4GALT1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit B4GALT1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Laboratory abnormality
- Abnormal isoelectric focusing of serum transferrin
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Abnormal circulating enzyme concentration or activity
- Type II transferrin isoform profile
- Decreased circulating LDL-C concentration
- High liver enzymes
- Fluid retention
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-18: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.18-8b139e39.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen B4GALT1: beta-1,4-galactosyltransferase 1. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/b4galt1
Dante Labs. Gen B4GALT1: beta-1,4-galactosyltransferase 1 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/b4galt1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů