Gen
B4GALT1
beta-1,4-galactosyltransferase 1
- HGNC 924↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000086062↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 2683↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 9p21.1
- Koordinater
- Kromosom 9: 33.110.642–33.167.336 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner fordelt over 56,7 kb
- Protein
- 398 aminosyrer
- Også kendt som
- beta4Gal-T1
- Tidligere symboler
- GGTB2
- MANE Select-transkript
- ENST00000379731.5NM_001497.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/b4galt1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs B4GALT1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Medfødte glykosyleringsforstyrrelser
- Medfødte glykosyleringsforstyrrelser (CDG)
Et af 98 gener, der er knyttet til det
En stor gruppe arvelige tilstande, hvor sukkerkæder (glykaner) ikke dannes eller sættes korrekt på proteiner og lipider. De rammer ofte hjernen, leveren, blodets evne til at størkne, væksten og mange andre organsystemer. De fleste nedarves autosomalt recessivt, men nogle er X-bundne eller autosomalt dominante.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er B4GALT1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 4,2 kb af genets 56,7 kb; 1.197 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af B4GALT1
2Lav
Hvor svært B4GALT1 er at sekventere med korte læsninger, på en skala fra 0 til 100Hver søjle viser andelen af B4GALT1s exonbaser i den pågældende type vanskeligt område. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver enkelt koster et kald baseret på korte læsninger: 0, når ingen base ligger i nogen, og 100, når hver base ligger i alle af dem.
- MappabilitetStrækninger, hvor læsninger på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald dér kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og serier af én base, som læsninger glider på, og som muligvis ikke kan spændes over. Vægt 15 %.3,9 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker dårligt. Vægt 10 %.14 %
- ReferencedækningHuller i referencesamlingen i nærheden, hvor der ikke findes nogen sekvens, som læsningerne kan justeres mod. Vægt 10 %.0 %
Gener knyttet til de samme sygdomme
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Deler 1 sygdom
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 sygdom
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 sygdom
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 1 sygdom
Træk knyttet til B4GALT1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, B4GALT1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Laboratory abnormality
- Abnormal isoelectric focusing of serum transferrin
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Abnormal circulating enzyme concentration or activity
- Type II transferrin isoform profile
- Decreased circulating LDL-C concentration
- High liver enzymes
- Fluid retention
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). B4GALT1-genet: beta-1,4-galactosyltransferase 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/b4galt1
Dante Labs. B4GALT1-genet: beta-1,4-galactosyltransferase 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/b4galt1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger