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Gene

SLC39A13

solute carrier family 39 member 13

Resumo

Localização citogenética
11p11.2
Coordenadas
Cromossoma 11: 47 408 590–47 416 496 (GRCh38)
Exões
10 exões ao longo de 7,9 kb
Proteína
371 aminoácidos
Também conhecido como
FLJ25785, LZT-Hs9, ZIP13, ZIP-13
Transcrito MANE Select
ENST00000362021.9NM_001128225.3
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Genoma de referênciaGRCh38

As posições nas páginas de genes e variantes seguem esta escolha, neste navegador.

Relatório com curadoria relevante para este gene

  • Síndrome de Ehlers-Danlos

      • A ClinGen classifica a associação como definitiva
      • 5 submissores GenCC classificam-na como definitiva ou forte

Como SLC39A13 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Locais conhecidos associados a doença
Cromossoma 11, com um parêntese onde se situa SLC39A13. SLC39A13 e 22 genes próximos no cromossoma 11, de 46 912 543 a 47 912 542.Cromossoma 1111p11.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2547 Mb47,2 Mb47,4 Mb47,6 Mb47,8 MbLRP4: 46 856 717–46 918 642, fita inversaLRP4CSTPP1: 46 936 689–47 165 535, fita diretaCSTPP1ARFGAP2: 47 135 667–47 177 474, fita inversaARFGAP2PACSIN3: 47 177 511–47 187 487, fita inversaPACSIN3DDB2: 47 214 435–47 240 555, fita diretaDDB2ACP2: 47 237 598–47 249 288, fita inversaACP2NR1H3: 47 248 300–47 269 131, fita diretaNR1H3MADD: 47 269 161–47 330 038, fita diretaMADDMYBPC3: 47 331 406–47 352 702, fita inversaMYBPC3SPI1: 47 354 860–47 409 369, fita inversaSPI1SLC39A13: 47 408 590–47 416 496, fita diretaSLC39A13PSMC3: 47 418 765–47 426 488, fita inversaPSMC3RAPSN: 47 436 816–47 449 192, fita inversaRAPSNCELF1: 47 465 933–47 565 569, fita inversaCELF1NDUFS3: 47 565 336–47 584 565, fita diretaNDUFS3PTPMT1: 47 565 430–47 573 461, fita diretaPTPMT1KBTBD4: 47 572 196–47 578 982, fita inversaKBTBD4FAM180B: 47 586 207–47 589 195, fita diretaC1QTNF4: 47 589 666–47 595 642, fita inversaMTCH2: 47 604 339–47 642 698, fita inversaAGBL2: 47 659 591–47 715 389, fita inversaAGBL2FNBP4: 47 716 494–47 767 460, fita inversaFNBP4NUP160: 47 777 872–47 848 561, fita inversaNUP160Diagrama de SLC39A13: 10 exões na cadeia direta do cromossoma 11Exão 3: 1 local conhecido associado a doençaExão 4: 1 local conhecido associado a doençaExão 1: 47 408 590–47 408 662, 73 basesExão 2: 47 410 087–47 410 395, 309 basesExão 3: 47 411 926–47 412 039, 114 basesExão 4: 47 412 346–47 412 467, 122 basesExão 5: 47 413 400–47 413 507, 108 basesExão 6: 47 413 597–47 413 686, 90 basesExão 7: 47 414 425–47 414 475, 51 basesExão 8: 47 414 777–47 414 909, 133 basesExão 9: 47 415 039–47 415 159, 121 basesExão 10: 47 415 288–47 416 496, 1209 bases123456789105′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 2,3 kb dos 7,9 kb do gene; 1116 dessas bases codificam a proteína.

Como um teste de genoma lê SLC39A13

2

posições em SLC39A13 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica

Nenhuma delas se situa numa região onde as leituras curtas têm dificuldade.

Um genoma completo abrange todos os 7,9 kb de SLC39A13, incluindo os intrões, e não apenas os 2,3 kb de exões.

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • GenCC e ClinGen, publicado em 2026-10-16: as condições a que o gene está associado e o grau dessa associação.
  • A lista ACMG de achados secundários, SF v3.2.
  • ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
  • Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene SLC39A13: solute carrier family 39 member 13. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/slc39a13

Vancouver

Dante Labs. Gene SLC39A13: solute carrier family 39 member 13 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/slc39a13

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