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Gène

SLC39A13

solute carrier family 39 member 13

Résumé

Localisation cytogénétique
11p11.2
Coordonnées
Chromosome 11 : 47 408 590–47 416 496 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 7,9 kb
Protéine
371 acides aminés
Aussi appelé
FLJ25785, LZT-Hs9, ZIP13, ZIP-13
Transcrit MANE Select
ENST00000362021.9NM_001128225.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Structure de SLC39A13

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de SLC39A13. SLC39A13 et 22 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 46 912 543 à 47 912 542.Chromosome 1111p11.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2547 Mb47,2 Mb47,4 Mb47,6 Mb47,8 MbLRP4 : 46 856 717–46 918 642, brin inverseLRP4CSTPP1 : 46 936 689–47 165 535, brin directCSTPP1ARFGAP2 : 47 135 667–47 177 474, brin inverseARFGAP2PACSIN3 : 47 177 511–47 187 487, brin inversePACSIN3DDB2 : 47 214 435–47 240 555, brin directDDB2ACP2 : 47 237 598–47 249 288, brin inverseACP2NR1H3 : 47 248 300–47 269 131, brin directNR1H3MADD : 47 269 161–47 330 038, brin directMADDMYBPC3 : 47 331 406–47 352 702, brin inverseMYBPC3SPI1 : 47 354 860–47 409 369, brin inverseSPI1SLC39A13 : 47 408 590–47 416 496, brin directSLC39A13PSMC3 : 47 418 765–47 426 488, brin inversePSMC3RAPSN : 47 436 816–47 449 192, brin inverseRAPSNCELF1 : 47 465 933–47 565 569, brin inverseCELF1NDUFS3 : 47 565 336–47 584 565, brin directNDUFS3PTPMT1 : 47 565 430–47 573 461, brin directPTPMT1KBTBD4 : 47 572 196–47 578 982, brin inverseKBTBD4FAM180B : 47 586 207–47 589 195, brin directC1QTNF4 : 47 589 666–47 595 642, brin inverseMTCH2 : 47 604 339–47 642 698, brin inverseAGBL2 : 47 659 591–47 715 389, brin inverseAGBL2FNBP4 : 47 716 494–47 767 460, brin inverseFNBP4NUP160 : 47 777 872–47 848 561, brin inverseNUP160Schéma de SLC39A13 : 10 exons sur le brin direct du chromosome 11Exon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 47 408 590–47 408 662, 73 basesExon 2 : 47 410 087–47 410 395, 309 basesExon 3 : 47 411 926–47 412 039, 114 basesExon 4 : 47 412 346–47 412 467, 122 basesExon 5 : 47 413 400–47 413 507, 108 basesExon 6 : 47 413 597–47 413 686, 90 basesExon 7 : 47 414 425–47 414 475, 51 basesExon 8 : 47 414 777–47 414 909, 133 basesExon 9 : 47 415 039–47 415 159, 121 basesExon 10 : 47 415 288–47 416 496, 1 209 bases123456789105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,3 kb sur les 7,9 kb du gène ; 1 116 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SLC39A13

2

positions dans SLC39A13 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 7,9 kb de SLC39A13, introns compris, et pas seulement les 2,3 kb d'exons.

Gènes liés aux mêmes affections

Traits associés à SLC39A13

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SLC39A13 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLC39A13 : solute carrier family 39 member 13. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slc39a13

Vancouver

Dante Labs. Gène SLC39A13 : solute carrier family 39 member 13 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slc39a13

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