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Gen

SLC39A13

solute carrier family 39 member 13

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
11p11.2
Koordinaten
Chromosom 11: 47.408.590–47.416.496 (GRCh38)
Exons
10 Exons über 7,9 kb
Protein
371 Aminosäuren
Auch bekannt als
FLJ25785, LZT-Hs9, ZIP13, ZIP-13
MANE-Select-Transkript
ENST00000362021.9NM_001128225.3
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierter Bericht zu diesem Gen

  • Ehlers-Danlos-Syndrom

      • ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
      • 5 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark

Aufbau von SLC39A13

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Bekannte krankheitsverursachende Stellen
Chromosom 11, mit einer Klammer, an der SLC39A13 liegt. SLC39A13 und 22 Gene in der Nähe auf Chromosom 11, von 46.912.543 bis 47.912.542.Chromosom 1111p11.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2547 Mb47,2 Mb47,4 Mb47,6 Mb47,8 MbLRP4: 46.856.717–46.918.642, Minus-StrangLRP4CSTPP1: 46.936.689–47.165.535, Plus-StrangCSTPP1ARFGAP2: 47.135.667–47.177.474, Minus-StrangARFGAP2PACSIN3: 47.177.511–47.187.487, Minus-StrangPACSIN3DDB2: 47.214.435–47.240.555, Plus-StrangDDB2ACP2: 47.237.598–47.249.288, Minus-StrangACP2NR1H3: 47.248.300–47.269.131, Plus-StrangNR1H3MADD: 47.269.161–47.330.038, Plus-StrangMADDMYBPC3: 47.331.406–47.352.702, Minus-StrangMYBPC3SPI1: 47.354.860–47.409.369, Minus-StrangSPI1SLC39A13: 47.408.590–47.416.496, Plus-StrangSLC39A13PSMC3: 47.418.765–47.426.488, Minus-StrangPSMC3RAPSN: 47.436.816–47.449.192, Minus-StrangRAPSNCELF1: 47.465.933–47.565.569, Minus-StrangCELF1NDUFS3: 47.565.336–47.584.565, Plus-StrangNDUFS3PTPMT1: 47.565.430–47.573.461, Plus-StrangPTPMT1KBTBD4: 47.572.196–47.578.982, Minus-StrangKBTBD4FAM180B: 47.586.207–47.589.195, Plus-StrangC1QTNF4: 47.589.666–47.595.642, Minus-StrangMTCH2: 47.604.339–47.642.698, Minus-StrangAGBL2: 47.659.591–47.715.389, Minus-StrangAGBL2FNBP4: 47.716.494–47.767.460, Minus-StrangFNBP4NUP160: 47.777.872–47.848.561, Minus-StrangNUP160Diagramm von SLC39A13: 10 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 11Exon 3: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 4: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 1: 47.408.590–47.408.662, 73 BasenExon 2: 47.410.087–47.410.395, 309 BasenExon 3: 47.411.926–47.412.039, 114 BasenExon 4: 47.412.346–47.412.467, 122 BasenExon 5: 47.413.400–47.413.507, 108 BasenExon 6: 47.413.597–47.413.686, 90 BasenExon 7: 47.414.425–47.414.475, 51 BasenExon 8: 47.414.777–47.414.909, 133 BasenExon 9: 47.415.039–47.415.159, 121 BasenExon 10: 47.415.288–47.416.496, 1.209 Basen123456789105′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 2,3 kb der 7,9 kb des Gens aus; 1.116 dieser Basen kodieren für das Protein.

So liest ein Gentest SLC39A13

2

Positionen in SLC39A13, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft

Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.

Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 7,9 kb von SLC39A13, einschließlich der Introns, und nicht nur die 2,3 kb Exons.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
  • Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
  • ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
  • Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
  • Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (o. J.). SLC39A13-Gen: solute carrier family 39 member 13. Abgerufen am 16. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/slc39a13

Vancouver

Dante Labs. SLC39A13-Gen: solute carrier family 39 member 13 [Internet]. [zitiert am 16. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/slc39a13

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