Gen
GJB1
gap junction protein beta 1
- HGNC 4283↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000169562↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 2705↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- Xq13.1
- Współrzędne
- Chromosom X: 71 223 224–71 225 516 (GRCh38)
- Eksony
- 2 eksonów na odcinku 2,3 kb
- Białko
- 283 aminokwasów
- Znany również jako
- CX32
- Poprzednie symbole
- CMTX1, CMTX
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000361726.7NM_000166.6
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gjb1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj GJB1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Choroba Charcota-Mariego-Tootha
Jeden z 62 powiązanych z nim genów
Grupa dziedzicznych neuropatii obwodowych, prowadzących do postępującego osłabienia i zaniku mięśni dystalnych oraz utraty czucia, głównie w stopach i dłoniach.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Poradnictwo genetyczne, monitorowanie zależne od podtypu, fizjoterapia, ortezy, unikanie leków neurotoksycznych, badania kliniczne ukierunkowane na konkretne geny, kontrola cech towarzyszących
Rzadkie dziedziczne neuropatie obwodowe
- Dziedziczna neuropatia obwodowa
Jeden z 233 powiązanych z nim genów
Spowodowana zmianami w jednym z wielu genów potrzebnych do utrzymania długich włókien nerwowych w dobrym stanie. W tym raporcie należą do nich IGHMBP2 i PLEKHG5, które mają dziedziczenie recesywne.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Fizjoterapia, ortezy i terapia zajęciowa pomagają utrzymać sprawność ruchową, a w razie potrzeby stosuje się operacje deformacji stóp. Niektóre postacie wymagają monitorowania oddychania. Poradnictwo genetyczne kieruje badaniami rodziny zgodnie ze wzorcem dziedziczenia danego genu.
Budowa genu GJB1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,9 kb z 2,3 kb genu; 852 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie GJB1
4Łatwy
Stopień trudności sekwencjonowania genu GJB1 krótkimi odczytami w skali 0–100
0 · Łatwy100 · Trudny
Niemal wszystkie eksony genu GJB1 znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty są mapowane poprawnie.
Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu GJB1 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się umieścić jednoznacznie, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 100%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Waga 60%.0%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, gdzie nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 50%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować w całości. Waga 30%.5,5%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% zawartości G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 20%.13%
Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów genu GJB1 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie leży w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się tam, gdzie odczytów nie da się umieścić jednoznacznie.
101
pozycje w GJB1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 2,3 kb genu GJB1, łącznie z intronami, a nie tylko 1,9 kb eksonów.
ClinVar pathogenic variants (110)
The GJB1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenny 41
- Patogenny/prawdopodobnie patogenny 8
- Prawdopodobnie patogenny 61
| Wariant | Conditions | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_000166.6(GJB1):c.-17G>A (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.43C>T (p.Arg15Trp) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease and 1 other | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.44G>A (p.Arg15Gln) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.64C>T (p.Arg22Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease and 1 other | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.187G>A (p.Val63Ile) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.223C>T (p.Arg75Trp) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.224G>A (p.Arg75Gln) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.271G>A (p.Val91Met) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.305A>G (p.Glu102Gly) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.319C>T (p.Arg107Trp) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.415G>A (p.Val139Met) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.424C>T (p.Arg142Trp) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.491G>A (p.Arg164Gln) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 and 1 other | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.541G>A (p.Val181Met) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.658C>T (p.Arg220Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease and 1 other | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.-103C>T (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease and 1 other | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.65G>A (p.Arg22Gln) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.260C>G (p.Pro87Arg) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.283G>A (p.Val95Met) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.490C>T (p.Arg164Trp) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.547C>T (p.Arg183Cys) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.556G>A (p.Glu186Lys) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.643C>T (p.Arg215Trp) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.52A>T (p.Thr18Ser) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000166.6(GJB1):c.386G>A (p.Gly129Glu) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease X-linked dominant 1 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
See all 110 with every other GJB1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólnych schorzeń: 2
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Wspólnych schorzeń: 2
- ATP1A1ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1Wspólnych schorzeń: 2
- CADM3cell adhesion molecule 3Wspólnych schorzeń: 2
- COX6A1cytochrome c oxidase subunit 6A1Wspólnych schorzeń: 2
- DHTKD1dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1Wspólnych schorzeń: 2
- DHX9DExH-box helicase 9Wspólnych schorzeń: 2
- DNM2dynamin 2Wspólnych schorzeń: 2
- DRP2dystrophin related protein 2Wspólnych schorzeń: 2
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Wspólnych schorzeń: 2
- EGR2early growth response 2Wspólnych schorzeń: 2
- FBLN5fibulin 5Wspólnych schorzeń: 2
Cechy powiązane z genem GJB1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać GJB1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Decreased motor nerve conduction velocity
- Decreased number of peripheral myelinated nerve fibers
- Onion bulb formation
- Abnormal gait
- Abnormal nerve conduction velocity
- Absent reflexes
- Damage to nerves that sense feeling
- Progressive cerebellar ataxia
Pokaż jeszcze 33 cech
- Axonal loss
- Cerebellar vermis atrophy
- Clumsiness
- Decreased sensation in extremities
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Hand tremor
- Impaired pain sensation
- Increased reflexes
- Intention tremor
- Lack of coordination of movement
- Limb ataxia
- Motor delay
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Progressive gait ataxia
- Spinocerebellar tract degeneration
- Toe walking
- Unsteady walk
- Ataxia
- Babinski sign
- Degeneration of cerebellum
- Difficulty articulating speech
- Excessive daytime sleepiness
- Incoordination
- Language impairment
- Overactive lower leg reflex
- Tremor
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Axonal degeneration
- Decreased reflex response
- Loss of expressive speech
- Partial paralysis of legs
- Peripheral axonal degeneration
- Peripheral neuropathy
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-18: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.18-8b139e39.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen GJB1: gap junction protein beta 1. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/gjb1
Dante Labs. Gen GJB1: gap junction protein beta 1 [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/gjb1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni