Gen
VPS13A
vacuolar protein sorting 13 homolog A
- HGNC 1908↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000197969↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 23230↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 9q21.2
- Koordinater
- Kromosom 9: 77 177 534–77 421 537 (GRCh38)
- Eksoner
- 72 eksoner over 244 kb
- Protein
- 3 174 aminosyrer
- Også kjent som
- KIAA0986, BLTP5A
- Tidligere symboler
- CHAC
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000360280.8NM_033305.3
- Lokustype
- Protein-coding
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/vps13a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes VPS13A og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Nevroakantocytose og fenokopier av Huntingtons sykdom
- Nevroakantocytose
En gruppe lidelser med unormalt formede røde blodceller og nevrodegenerasjon, inkludert VPS13A-relatert chorea-acanthocytosis (recessiv) og XK-relatert McLeods syndrom (X-bundet).
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Nevrologisk og psykiatrisk behandling. Personer med McLeods syndrom trenger Kell-kompatibelt blod dersom de får blodoverføring.
Slik er VPS13A bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 15,2 kb av genets 244 kb, og 9 525 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av VPS13A
468
posisjoner i VPS13A der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 244 kb av VPS13A, inkludert introner, ikke bare de 15,2 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
Egenskaper knyttet til VPS13A
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene VPS13A kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Caudate atrophy
- Chorea
- Difficulty articulating speech
- Lack of feeling, emotion, interest
- Lateral ventricle dilatation
- Orofacial dyskinesia
- Peripheral axonal neuropathy
- Self-mutilation of tongue and lips due to involuntary movements
Vis 60 egenskaper til
- Teeth grinding
- Involuntary movements
- Absent reflexes
- Anxiety
- Behavioral abnormality
- Decreased amplitude of sensory action potentials
- Decreased reflex response
- Depression
- Diminished deep tendon reflex
- Epilepsy
- Falls
- Grand mal seizures
- Impaired vibratory sensation
- Incoordination
- Laryngeal dystonia
- Limb dystonia
- Motor tics
- Parkinsonism
- Phonic tics
- Abnormal hippocampus morphology
- Abnormal putamen morphology
- Aggressive behavior
- Can't control feelings
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased number of peripheral myelinated nerve fibers
- Dementia
- Frontal cortical atrophy
- Hair-pulling
- Head titubation
- Head-banging
- Hyperactive movements
- Inappropriate behavior
- Irritability
- Lingual dystonia
- Loss of ability to walk
- Mental deterioration
- Mental slowness
- Micrographia
- More active than typical
- Obsessive compulsive behavior
- Oromandibular dystonia
- Paranoia
- Resting tremor
- Self-injurious behavior
- Self-neglect
- Short attention span
- Slow movements
- Slurred speech
- Small basal ganglia
- Small hippocampus
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Difficulty sleeping
- Iron accumulation in brain
- Damage to nerves that sense feeling
- Disinhibition
- Dystonia
- Personality changes
- Progressive choreoathetosis
- Psychosis
- Tic disorder
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Distal muscle wasting
- EMG: neuropathic changes
- Muscle fiber degeneration
- Muscle tissue disease
- Weakness of outermost muscles
- Arthritis
- Functional motor deficit
Vis 2 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). VPS13A-genet: vacuolar protein sorting 13 homolog A. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/vps13a
Dante Labs. VPS13A-genet: vacuolar protein sorting 13 homolog A [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/vps13a
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker