Genas
FOXC1
forkhead box C1
- HGNC 3800↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000054598↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 2296↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 6p25.3
- Koordinatės
- Chromosoma 6: 1 609 915–1 613 897 (GRCh38)
- Eksonai
- 1 eksonas per 4 kb
- Baltymas
- 553 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Taip pat žinomas kaip
- FREAC3, ARA, IGDA, IHG1
- Ankstesni simboliai
- FKHL7, IRID1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000645831.2NM_001453.3
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite FOXC1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Priekinio akies segmento disgenezė, Axenfeld-Rieger sindromas ir aniridija
- Axenfeld-Rieger sindromasAutosominis dominantinis
Dominuojanti liga, kurią sukelia PITX2 ar FOXC1 pakitimai; ji veikia rainelę ir drenažo kampą, kartais dantis, veidą ir bambą.
- 3 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Rekomenduojama visą gyvenimą stebėti, ar nėra glaukomos, nes apie pusė sergančiųjų ja suserga.
- Priekinio akies segmento disgenezė
Priekinės akies dalies vystymosi sutrikimų grupė, įskaitant Peters anomaliją, kurią sukelia genų, tokių kaip FOXC1, PITX3, FOXE3, CYP1B1 ir CPAMD8, pakitimai.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Visą gyvenimą yra didelė glaukomos rizika, todėl rekomenduojama reguliariai stebėti akispaudimą.
Glaukoma
Padidėjęs akies obuolio spaudimas dėl sutrikusio drėgmės (vandeninio skysčio) nutekėjimo iš akies.
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Akispūdį mažinantys lašai (prostaglandinų analogai, beta blokatoriai); selektyvi lazerinė trabekuloplastika; MIGS chirurgija; trabekulotomija / goniotomija įgimtai glaukomai; kaskadinis šeimos genetinis tyrimas; kasmetinis akispūdžio stebėjimas nešiotojams
Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Pakanka vieno pakitusio egzemplioriaus iš bet kurio iš tėvų. Tėvas ar motina, turintys tokį pakitimą, perduoda jį kiekvienam vaikui su vienos iš dviejų tikimybe.
Kaip išdėstytas FOXC1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4 kb iš 4 kb geno; 1 662 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito FOXC1
109
FOXC1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Iš jų 4 (3,7 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
- Low mappability (4 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 4 kb FOXC1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 4 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- PITX2paired like homeodomain 2Turi 2 bendrų būklių
- CPAMD8C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8Turi 1 bendrą būklę
- CYP1B1cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1Turi 1 bendrą būklę
- EFEMP1EGF-like fibulin extracellular matrix protein 1Turi 1 bendrą būklę
- FOXE3forkhead box E3Turi 1 bendrą būklę
- ITPR1inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1Turi 1 bendrą būklę
- LTBP2latent transforming growth factor beta binding protein 2Turi 1 bendrą būklę
- MYOCmyocilinTuri 1 bendrą būklę
- OPTNoptineurinTuri 1 bendrą būklę
- PAX6paired box 6Turi 1 bendrą būklę
- PITX3paired like homeodomain 3Turi 1 bendrą būklę
- PXDNperoxidasinTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su FOXC1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti FOXC1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the eye
- Displaced pupil
- Peters anomaly
- Posterior embryotoxon
- Underdeveloped iris
- Abnormal anterior chamber morphology
- Absent iris
- Absent/small iris
- Anterior synechiae of the anterior chamber
Rodyti dar 34 savybių
- Aplasia/Hypoplasia of the macula
- Central opacification of the cornea
- Decreased clarity of vision
- Hypoplasia of the fovea
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Opacification of the corneal stroma
- Subcapsular cataract
- Thinning of Descemet membrane
- Visual loss
- Abnormal foveal pit on macular OCT
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormal multifocal electroretinogram
- Clouding of the lens of the eye
- Corneal opacity
- Cross-eyed
- Developmental glaucoma
- Ectopia lentis
- Fundus hypopigmentation
- Glaucoma
- Hypoplastic iris stroma
- Limbal stem cell deficiency
- New blood vessel formation in cornea
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Red green color blindness
- Wide-set eyes
- Abnormally small eyeball
- Axenfeld anomaly
- Drooping upper eyelid
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Optic nerve hypoplasia
- Lens coloboma
- Microspherophakia
- Bulging eye
- Rieger anomaly
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). FOXC1 genas: forkhead box C1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/foxc1
Dante Labs. FOXC1 genas: forkhead box C1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/foxc1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites