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Gène

HPGD

15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase

Résumé

Localisation cytogénétique
4q34.1
Coordonnées
Chromosome 4 : 174 490 175–174 522 488 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 32,3 kb
Protéine
266 acides aminés
Aussi appelé
SDR36C1
Transcrit MANE Select
ENST00000296522.11NM_000860.6
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HPGD. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HPGD

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 4, avec un crochet à l'emplacement de HPGD. HPGD et 4 gènes à proximité sur le chromosome 4, de 174 006 332 à 175 006 331.Chromosome 44q34.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.2174,2 Mb174,4 Mb174,6 Mb174,8 Mb175 MbFBXO8 : 174 236 526–174 283 978, brin inverseFBXO8CEP44 : 174 283 295–174 335 043, brin directCEP44HPGD : 174 490 175–174 522 488, brin inverseHPGDGLRA3 : 174 636 920–174 829 247, brin inverseGLRA3ADAM29 : 174 829 668–174 978 180, brin directADAM29Schéma de HPGD : 7 exons sur le brin inverse du chromosome 4Exon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 3 : 4 sites connus associés à une maladieExon 2 : 3 sites connus associés à une maladieExon 1 : 1 site connu associé à une maladieExon 7 : 174 490 175–174 492 094, 1 920 basesExon 6 : 174 493 151–174 493 314, 164 basesExon 5 : 174 495 548–174 495 624, 77 basesExon 4 : 174 508 696–174 508 792, 97 basesExon 3 : 174 517 971–174 518 077, 107 basesExon 2 : 174 521 944–174 522 067, 124 basesExon 1 : 174 522 359–174 522 488, 130 bases7515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,6 kb sur les 32,3 kb du gène ; 801 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit HPGD

14

positions dans HPGD où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 32,3 kb de HPGD, introns compris, et pas seulement les 2,6 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène HPGD : 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hpgd

Vancouver

Dante Labs. Gène HPGD : 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hpgd

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