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Gene

HPGD

15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase

Sintesi

Localizzazione citogenetica
4q34.1
Coordinate
Cromosoma 4: 174.490.175–174.522.488 (GRCh38)
Esoni
7 esoni su 32,3 kb
Proteina
266 amminoacidi
Noto anche come
SDR36C1
Trascritto MANE Select
ENST00000296522.11NM_000860.6
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora HPGD. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di HPGD

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 4, con una parentesi dove si trova HPGD. HPGD e 4 geni nelle vicinanze sul cromosoma 4, da 174.006.332 a 175.006.331.Cromosoma 44q34.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.2174,2 Mb174,4 Mb174,6 Mb174,8 Mb175 MbFBXO8: 174.236.526–174.283.978, filamento inversoFBXO8CEP44: 174.283.295–174.335.043, filamento direttoCEP44HPGD: 174.490.175–174.522.488, filamento inversoHPGDGLRA3: 174.636.920–174.829.247, filamento inversoGLRA3ADAM29: 174.829.668–174.978.180, filamento direttoADAM29Diagramma di HPGD: 7 esoni sul filamento inverso del cromosoma 4Esone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 5: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 4: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 3: 4 siti noti causativi di malattiaEsone 2: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 1: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 7: 174.490.175–174.492.094, 1920 basiEsone 6: 174.493.151–174.493.314, 164 basiEsone 5: 174.495.548–174.495.624, 77 basiEsone 4: 174.508.696–174.508.792, 97 basiEsone 3: 174.517.971–174.518.077, 107 basiEsone 2: 174.521.944–174.522.067, 124 basiEsone 1: 174.522.359–174.522.488, 130 basi7515′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,6 kb dei 32,3 kb del gene; 801 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di HPGD

14

posizioni in HPGD in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di queste ricade in una regione che le letture corte faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 32,3 kb di HPGD, introni compresi, non solo i 2,6 kb di esoni.

Tratti collegati a HPGD

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che HPGD può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene HPGD: 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/hpgd

Vancouver

Dante Labs. Gene HPGD: 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/hpgd

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