Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

HPGD

15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
4q34.1
Koordinaatit
Kromosomi 4: 174 490 175–174 522 488 (GRCh38)
Eksonit
7 eksonia 32,3 kb:n alueella
Proteiini
266 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
SDR36C1
MANE Select -transkripti
ENST00000296522.11NM_000860.6
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä HPGD. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

HPGD-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 4, jossa hakasulke osoittaa HPGD-geenin sijainnin. HPGD ja 4 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 4, välillä 174 006 332–175 006 331.Kromosomi 44q34.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.2174,2 Mb174,4 Mb174,6 Mb174,8 Mb175 MbFBXO8: 174 236 526–174 283 978, juoste taaksepäinFBXO8CEP44: 174 283 295–174 335 043, juoste eteenpäinCEP44HPGD: 174 490 175–174 522 488, juoste taaksepäinHPGDGLRA3: 174 636 920–174 829 247, juoste taaksepäinGLRA3ADAM29: 174 829 668–174 978 180, juoste eteenpäinADAM29HPGD-kaavio: 7 eksonia kromosomin 4 juosteella, taaksepäinEksoni 7: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 5: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 4: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 3: 4 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 2: 3 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 1: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEkson 7: 174 490 175–174 492 094, 1 920 emästäEkson 6: 174 493 151–174 493 314, 164 emästäEkson 5: 174 495 548–174 495 624, 77 emästäEkson 4: 174 508 696–174 508 792, 97 emästäEkson 3: 174 517 971–174 518 077, 107 emästäEkson 2: 174 521 944–174 522 067, 124 emästäEkson 1: 174 522 359–174 522 488, 130 emästä7515′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,6 kb geenin 32,3 kb:stä; 801 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä HPGD

14

HPGD-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 32,3 kb geenistä HPGD, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,6 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). HPGD-geeni: 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hpgd

Vancouver

Dante Labs. HPGD-geeni: 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hpgd

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test