Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

HPGD

15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
4q34.1
Koordinaadid
Kromosoom 4: 174 490 175–174 522 488 (GRCh38)
Eksonid
7 eksonit, ulatus 32,3 kb
Valk
266 aminohapet
Tuntud ka kui
SDR36C1
MANE Select transkript
ENST00000296522.11NM_000860.6
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni HPGD veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas HPGD on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 4, millel on sulg kohal, kus asub HPGD. HPGD ja sellele lähedal asuvad 4 geeni kromosoomil 4, vahemikus 174 006 332 kuni 175 006 331.Kromosoom 44q34.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.2174,2 Mb174,4 Mb174,6 Mb174,8 Mb175 MbFBXO8: 174 236 526–174 283 978, pöördne ahelFBXO8CEP44: 174 283 295–174 335 043, otsene ahelCEP44HPGD: 174 490 175–174 522 488, pöördne ahelHPGDGLRA3: 174 636 920–174 829 247, pöördne ahelGLRA3ADAM29: 174 829 668–174 978 180, otsene ahelADAM29HPGD skeem: 7 eksonit kromosoomi 4 pöördne ahelalEkson 7: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 3: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 2: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 1: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 7: 174 490 175–174 492 094, 1920 alustEkson 6: 174 493 151–174 493 314, 164 alustEkson 5: 174 495 548–174 495 624, 77 alustEkson 4: 174 508 696–174 508 792, 97 alustEkson 3: 174 517 971–174 518 077, 107 alustEkson 2: 174 521 944–174 522 067, 124 alustEkson 1: 174 522 359–174 522 488, 130 alust7515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,6 kb kogupikkusega 32,3 kb; neist 801 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse HPGD

14

kohad geenis HPGD, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni HPGD 32,3 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,6 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). HPGD geen: 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/hpgd

Vancouver

Dante Labs. HPGD geen: 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/hpgd

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test