Geeni
EPCAM
epithelial cell adhesion molecule
- HGNC 11529↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000119888↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 4072↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2p21
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 47 369 311–47 387 020 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 17,7 kb:n alueella
- Proteiini
- 314 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- Ly74, TROP1, GA733-2, EGP34, EGP40, EGP-2, KSA, CD326, Ep-CAM, HEA125, KS1/4, MK-1, MH99, MOC31, MOC-31, 323/A3, 17-1A, TACST-1, CO-17A, ESA, BerEp4, Ber-Ep4
- Aiemmat symbolit
- M4S1, MIC18, TACSTD1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000263735.9NM_002354.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue EPCAM ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Synnynnäinen ripuli ja enteropatiat
- Synnynnäinen ripuli
Perinnölliset sairaudet, kuten synnynnäinen kloridiripuli (SLC26A3), mikrovillusinklusiotauti (MYO5B), tufting-enteropatia (EPCAM) ja synnynnäinen natriumripuli (SPINT2, SLC9A3), jotka aiheuttavat kroonista ripulia jo varhaisessa imeväisiässä.
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tarkka diagnoosi ohjaa hoitoa, esimerkiksi elektrolyyttikorvausta kloridiripulissa tai varhaista suunnittelua parenteraalisen ravitsemuksen tai suolensiirron osalta mikrovillusinklusiotaudissa ja tufting-enteropatiassa.
Lynch-oireyhtymä
- Autosomaalinen dominantti
Perinnöllinen ei-polypoottinen paksusuolensyöpäoireyhtymä, jonka aiheuttaa perimän DNA:n korjausmekanismin vika. Siihen liittyy paksusuolen, kohdunrungon ja muiden syöpien varhainen ilmaantuminen.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tehostettu paksusuolen tähystysseuranta, asetyylisalisyylihapon käyttö syövän ehkäisyyn, immuunitarkistuspisteen estäjät MSI-high-kasvaimiin, sukulaisten geneettinen testaus ja riskiä pienentävä gynekologinen leikkaus
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
EPCAM-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,5 kb geenin 17,7 kb:stä; 945 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä EPCAM
24
EPCAM-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 17,7 kb geenistä EPCAM, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- DGAT1diacylglycerol O-acyltransferase 1Yhteinen sairaus: 1
- GUCY2Cguanylate cyclase 2CYhteinen sairaus: 1
- MLH1mutL homolog 1Yhteinen sairaus: 1
- MSH2mutS homolog 2Yhteinen sairaus: 1
- MSH6mutS homolog 6Yhteinen sairaus: 1
- MYO5Bmyosin VBYhteinen sairaus: 1
- NEUROG3neurogenin 3Yhteinen sairaus: 1
- PLVAPplasmalemma vesicle associated proteinYhteinen sairaus: 1
- PMS2PMS1 homolog 2, mismatch repair system componentYhteinen sairaus: 1
- SLC26A3solute carrier family 26 member 3Yhteinen sairaus: 1
- SLC5A1solute carrier family 5 member 1Yhteinen sairaus: 1
- SLC9A3solute carrier family 9 member A3Yhteinen sairaus: 1
Geeniin EPCAM liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita EPCAM voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the digestive system
- Crypt hyperplasia
- Intractable diarrhea
- Villous atrophy
- Abdominal pain
- Chronic diarrhea
- Constipation
- Malabsorption
- Abdominal bloating
Näytä 18 piirrettä lisää
- Abnormal small intestinal mucosa morphology
- Colon cancer
- Fat in feces
- Nausea and vomiting
- Rectal tumor
- Secretory diarrhea
- Stomach tumor
- Abnormal large intestinal mucosa morphology
- Adenomatous colonic polyposis
- Cancer of the pancreas
- Growths in inner lining of intestine
- Hepatocellular carcinoma
- Liver cancer
- Pancreatic adenocarcinoma
- Absent anus
- Cholestatic liver disease
- Vomiting
- Hereditary nonpolyposis colorectal carcinoma
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Näytä 15 piirrettä lisää
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). EPCAM-geeni: epithelial cell adhesion molecule. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/epcam
Dante Labs. EPCAM-geeni: epithelial cell adhesion molecule [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/epcam
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa