Geeni
SLC5A1
solute carrier family 5 member 1
- HGNC 11036↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000100170↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6523↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 22q12.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 22: 32 043 261–32 113 029 (GRCh38)
- Eksonit
- 15 eksonia 69,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 664 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- D22S675, NAGT, SGLT-1
- Aiemmat symbolit
- SGLT1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000266088.9NM_000343.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SLC5A1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Synnynnäinen ripuli ja enteropatiat
- Synnynnäinen ripuli
Perinnölliset sairaudet, kuten synnynnäinen kloridiripuli (SLC26A3), mikrovillusinklusiotauti (MYO5B), tufting-enteropatia (EPCAM) ja synnynnäinen natriumripuli (SPINT2, SLC9A3), jotka aiheuttavat kroonista ripulia jo varhaisessa imeväisiässä.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tarkka diagnoosi ohjaa hoitoa, esimerkiksi elektrolyyttikorvausta kloridiripulissa tai varhaista suunnittelua parenteraalisen ravitsemuksen tai suolensiirron osalta mikrovillusinklusiotaudissa ja tufting-enteropatiassa.
Glukoosi-galaktoosimalabsorptio
- Autosomaalinen resessiivinen
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
SLC5A1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 69,8 kb:stä; 1 995 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SLC5A1
42
SLC5A1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 69,8 kb geenistä SLC5A1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,8 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- DGAT1diacylglycerol O-acyltransferase 1Yhteinen sairaus: 1
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeYhteinen sairaus: 1
- GUCY2Cguanylate cyclase 2CYhteinen sairaus: 1
- MYO5Bmyosin VBYhteinen sairaus: 1
- NEUROG3neurogenin 3Yhteinen sairaus: 1
- PLVAPplasmalemma vesicle associated proteinYhteinen sairaus: 1
- SLC26A3solute carrier family 26 member 3Yhteinen sairaus: 1
- SLC9A3solute carrier family 9 member A3Yhteinen sairaus: 1
- SPINT2serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2Yhteinen sairaus: 1
- STX3syntaxin 3Yhteinen sairaus: 1
- WNT2BWnt family member 2BYhteinen sairaus: 1
Geeniin SLC5A1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SLC5A1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SLC5A1-geeni: solute carrier family 5 member 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/slc5a1
Dante Labs. SLC5A1-geeni: solute carrier family 5 member 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/slc5a1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa