Geeni
BMPR1A
bone morphogenetic protein receptor type 1A
- HGNC 1076↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000107779↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 657↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 10q23.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 10: 86 756 619–86 927 969 (GRCh38)
- Eksonit
- 13 eksonia 171,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 532 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- ALK3, CD292
- Aiemmat symbolit
- ACVRLK3
- MANE Select -transkripti
- ENST00000372037.8NM_004329.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue BMPR1A ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Juveniilipolyposiaoireyhtymä
- Autosomaalinen dominantti
Ruoansulatuskanavan useita hamartomaattisia (juveniilejä) polyyppeja, joihin liittyy kohonnut paksusuolen- ja mahasyövän riski.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Säännölliset paksusuolen tähystykset ja ylemmän ruoansulatuskanavan tähystykset, yleensä teini-iästä alkaen, sekä polyyppien poisto. Sukulaisille voidaan tarjota testausta.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
BMPR1A-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 6,4 kb geenin 171,4 kb:stä; 1 599 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä BMPR1A
257
BMPR1A-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 98 (38 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (77 kohtaa)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (27 kohtaa)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Kokogenomi kattaa kaikki 171,4 kb geenistä BMPR1A, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 6,4 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (36)
Tässä ovat BMPR1A-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| c.67+1G>A | Introni 3 | 86 876 086 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.431-1G>C | Introni 6 | 86 900 026 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.676-1G>C | Introni 8 | 86 917 133 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.1166+2T>C | Introni 10 | 86 919 471 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.1343-2A>G | Introni 11 | 86 923 374 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| C376Wfs*5 | c.1127dup | Eksoni 10 | 86 919 429 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| D38Rfs*33 | c.111dup | Eksoni 4 | 86 890 104 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| E88X | c.262G>T | Eksoni 5 | 86 892 158 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| F83Hfs*6 | c.247_251del | Eksoni 5 | 86 892 138 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| G47X | c.139G>T | Eksoni 4 | 86 890 133 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
Geeniin BMPR1A liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita BMPR1A voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the digestive system
- Adenomatous colonic polyposis
- Abdominal pain
- Constipation
- Diarrhea
- Hyperplastic colonic polyposis
- Malabsorption
- Colon cancer
- Colorectal polyposis
Näytä 21 piirrettä lisää
- Gastrointestinal tract tumor
- Hamartomatous polyposis
- Juvenile colonic polyposis
- Multiple gastric polyps
- Nausea and vomiting
- Protein-losing enteropathy
- Rectal polyposis
- Rectal tumor
- Adenocarcinoma of the colon
- Cancer of the pancreas
- Colon tumor
- Duodenal adenocarcinoma
- Hepatocellular carcinoma
- Intussusception
- Pancreatic adenocarcinoma
- Rectum protrudes through anus
- Stomach tumor
- Duodenal polyposis
- Gastrointestinal desmoid tumor
- Small intestinal polyposis
- Stomach cancer
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Irritability
Näytä 19 piirrettä lisää
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Hemangioblastoma
- Intellectual disability, mild
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Motor delay
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Abnormality of head or neck
- Abnormal facial shape
- Big calvaria
- Large forehead
- Depressed nasal bridge
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Frontal bossing
- High, narrow palate
- Narrow mouth
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). BMPR1A-geeni: bone morphogenetic protein receptor type 1A. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/bmpr1a
Dante Labs. BMPR1A-geeni: bone morphogenetic protein receptor type 1A [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/bmpr1a
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa