Geen
TSHR
thyroid stimulating hormone receptor
- HGNC 12373↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000165409↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 7253↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 14q24-q31
- Koordinaadid
- Kromosoom 14: 80 955 621–81 146 306 (GRCh38)
- Eksonid
- 10 eksonit, ulatus 190,7 kb
- Valk
- 764 aminohapet
- Tuntud ka kui
- LGR3
- MANE Select transkript
- ENST00000298171.7NM_000369.5
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tshr.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe TSHR ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Kaasasündinud hüpotüreoidism
Kilpnäärmehormooni puudus, mis esineb juba sünnist saati.
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Hüpertüreoidism
Kilpnäärme liigtegevus, mille tulemuseks on kilpnäärmehormooni liigtootmine ja suurenenud ainevahetuskiirus. Põhjusteks on kilpnäärme difuusne hüperplaasia (Gravesi tõbi), kilpnäärme üksik sõlm ja türeoidiit. Sümptomid on seotud suurenenud ainevahetuskiirusega ning hõlmavad kaalulangust, väsimust, talumatust kuumuse suhtes, liigset higistamist, kõhulahtisust, tahhükardiat, unetust, lihasnõrkust ja treemorit.
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kilpnäärmevähk
- Hüpertüreoidism
Kilpnäärme liigtegevus, mis viib kilpnäärmehormooni liigtootmiseni ja suurenenud ainevahetuseni. Põhjusteks on kilpnäärme difuusne hüperplaasia (Gravesi tõbi), üksik kilpnäärmesõlm ja türeoiidiit. Sümptomid on seotud suurenenud ainevahetusega ning hõlmavad kaalulangust, väsimust, kuumatalumatust, liigset higistamist, kõhulahtisust, tahhükardiat, unetust, lihasnõrkust ja treemorit.
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Hüpotüreoidism
Kilpnäärmehormooni ebanormaalselt madal tase.
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Kilpnäärme haigus
Kilpnääret haarav haigus.
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas TSHR on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,3 kb kogupikkusega 190,7 kb; neist 2295 alust kodeerivad valku.
TSHR sekventeerimine
0Madal
Kui raske on TSHR lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100Iga riba näitab, kui suur osa TSHR eksoni aluspaaridest asub sellist liiki keerulises piirkonnas. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemiste analüüsi raskendab: 0, kui ükski alus ei asu üheski piirkonnas, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tehtud määrang puududa või olla vale. Kaal 35%.0%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: koopiad mujal genoomis, nagu paralogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- KordusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.1,3%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-osakaal on alla 25% või üle 65%; raamatukogu ettevalmistus katab neid nõrgalt. Kaal 10%.0%
- ViitekatvusLüngad lähedal asuvas viitekoostises, kuhu lugemised ei saa joonduda, sest järjestust seal ei ole. Kaal 10%.0%
51
positsioonid geenis TSHR, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Ükski neist ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti leiavad.
Kogu genoomi sekventeerimine katab kogu TSHR 190,7 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 4,3 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- DUOX2dual oxidase 2Jagab 3 haigust
- DUOXA2dual oxidase maturation factor 2Jagab 3 haigust
- IGSF1immunoglobulin superfamily member 1Jagab 3 haigust
- IRS4insulin receptor substrate 4Jagab 3 haigust
- IYDiodotyrosine deiodinaseJagab 3 haigust
- NKX2-5NK2 homeobox 5Jagab 3 haigust
- PAX8paired box 8Jagab 3 haigust
- SECISBP2SECIS binding protein 2Jagab 3 haigust
- SLC26A4solute carrier family 26 member 4Jagab 3 haigust
- SLC26A7solute carrier family 26 member 7Jagab 3 haigust
- SLC5A5solute carrier family 5 member 5Jagab 3 haigust
- TBL1Xtransducin beta like 1 X-linkedJagab 3 haigust
Geeniga TSHR seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida TSHR võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the endocrine system
- Activating thyroid-stimulating hormone receptor defect
- Decreased thyroid-stimulating hormone level
- Elevated circulating thyroid-stimulating hormone concentration
- Enlarged thyroid gland in neck
- Impaired sensitivity to thyroid stimulating hormone
- Increased circulating free T3
- Increased circulating T4 concentration
- Large thyroid
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-17: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). TSHR geen: thyroid stimulating hormone receptor. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tshr
Dante Labs. TSHR geen: thyroid stimulating hormone receptor [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tshr
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast