Gen
KCNJ2
potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2
- HGNC 6263↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000123700↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 3759↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 17q24.3
- Koordinater
- Kromosom 17: 70.169.532–70.180.044 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner fordelt over 10,5 kb
- Protein
- 427 aminosyrer
- Også kendt som
- Kir2.1, IRK1, LQT7
- MANE Select-transkript
- ENST00000243457.4NM_000891.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnj2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs KCNJ2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Familiær atrieflimmer
- Autosomal dominant
Atrieflimmer, der går i familier, og som er knyttet til ændringer i gener som KCNQ1, KCNJ2, GJA5, MYL4, NPPA og SCN5A.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Viden om dette understøtter tidligere EKG-kontroller for slægtninge og rettidig drøftelse af forebyggelse af apopleksi.
Familiær periodisk paralyse
- Periodisk paralyseAutosomal dominant
Redaktionsnote: klassificeret som genetisk i ORDO, men behandles her som neutral
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Long QT-syndrom
En forstyrrelse af hjertets repolarisering, kendetegnet ved et forlænget QT-interval og en risiko for farlige ventrikulære arytmier, såsom torsades de pointes.
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Betablokkere, ICD-implantation, aktivitetsbegrænsning, genetisk rådgivning
Short QT-syndrom
- Autosomal dominant
En genetisk sygdom i hjertets elektriske system, som består af en kombination af tegn og symptomer: et kort QT-interval på et EKG (< 300 ms), der ikke ændrer sig væsentligt med hjertefrekvensen, høje og spidse T-bølger samt et strukturelt normalt hjerte. Short QT-syndrom ser ud til at nedarves autosomalt dominant, og der er identificeret enkelte berørte familier
- ClinGen vurderer forbindelsen som moderat
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er KCNJ2 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 5,4 kb af genets 10,5 kb; 1.284 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af KCNJ2
3Let
Hvor svær KCNJ2 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle KCNJ2s exons ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.
Det, der lægger oven i: andelen af KCNJ2s exons i hver type svær region
- KortlægbarhedStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 100 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vægt 60 %.0 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan alignes til. Vægt 50 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 30 %.7,2 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 20 %.2 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af KCNJ2s exon-baser i den pågældende type svær region. Én type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er der, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
50
positioner i KCNJ2, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte reads har svært ved at finde.
En hel genomsekventering dækker alle 10,5 kb af KCNJ2, inklusive introns, og ikke kun de 5,4 kb af exons.
ClinVar pathogenic variants (57)
The KCNJ2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 40
- Patogen/sandsynligvis patogen 1
- Sandsynligvis patogen 16
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000891.3(KCNJ2):c.199C>T (p.Arg67Trp) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.244C>T (p.Arg82Trp) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.245G>A (p.Arg82Gln) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.430G>A (p.Gly144Ser) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.436G>A (p.Gly146Ser) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.652C>T (p.Arg218Trp) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.653G>A (p.Arg218Gln) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.899G>T (p.Gly300Val) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.934C>T (p.Arg312Cys) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.935G>A (p.Arg312His) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.200G>A (p.Arg67Gln) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.-217+1029_422del (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.13C>T (p.Arg5Ter) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.118C>T (p.Arg40Ter) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.212A>T (p.Asp71Val) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.224C>G (p.Thr75Arg) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.224C>T (p.Thr75Met) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.224C>A (p.Thr75Lys) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.232G>T (p.Asp78Tyr) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.232G>A (p.Asp78Asn) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.269T>G (p.Leu90Arg) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.351del (p.Glu118fs) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.431G>A (p.Gly144Asp) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.431G>C (p.Gly144Ala) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000891.3(KCNJ2):c.434A>G (p.Tyr145Cys) (opens in a new tab) | Andersen-Tawil syndrome and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
See all 57 with every other KCNJ2 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme sygdomme
- KCNQ1potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1Deler 3 sygdomme
- KCNH2potassium voltage-gated channel subfamily H member 2Deler 2 sygdomme
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CDeler 1 sygdom
- CACNA1Scalcium voltage-gated channel subunit alpha1 SDeler 1 sygdom
- CALM1calmodulin 1Deler 1 sygdom
- CALM2calmodulin 2Deler 1 sygdom
- CALM3calmodulin 3Deler 1 sygdom
- GJA5gap junction protein alpha 5Deler 1 sygdom
- KCNE1potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1Deler 1 sygdom
- MYL4myosin light chain 4Deler 1 sygdom
- SCN4Asodium voltage-gated channel alpha subunit 4Deler 1 sygdom
- SCN5Asodium voltage-gated channel alpha subunit 5Deler 1 sygdom
Træk knyttet til KCNJ2
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, KCNJ2 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of head or neck
- Dental crowding
- Little lower jaw
- Thin red part of the upper lip
- Abnormal dentition
- Abnormal facial shape
- Abnormality of dental color
- Broad forehead
- Bulbous nose
Vis 19 træk mere
- Decreased size of maxilla
- Delayed loss of baby teeth
- Facial asymmetry
- Failure of development of more than six teeth
- High palate
- Scaphocephaly
- Short opening between the eyelids
- Triangular face
- Wide nasal bridge
- Abnormally small head
- Antegonial notching of mandible
- Cleft palate
- Delayed eruption of permanent teeth
- Increased size of frontal sinus
- Narrow opening between the eyelids
- Pit in front of the ear
- Short mandibular rami
- Thin dental enamel
- Zygomatic flattening
Abnormality of the cardiovascular system
- Shortened QT interval
- Slow heartbeats
- Fainting spell
- Palpitations
- Paroxysmal atrial fibrillation
- Prolonged QT interval
- Prolonged QTc interval
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
Vis 16 træk mere
- Ventricular arrhythmia
- Abnormal T-wave
- Bidirectional ventricular ectopy
- Extra heart beat
- Heart attack
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Mildly reduced left ventricular ejection fraction
- Permanent atrial fibrillation
- Polymorphic and polytopic ventricular extrasystoles
- Polymorphic ventricular tachycardia
- Presyncope
- Prominent U wave
- Stretched and thinned heart muscle
- Sudden cardiac death
- Torsade de pointes
- Ventricular fibrillation
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-19: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.19-9814e911.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). KCNJ2-genet: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/kcnj2
Dante Labs. KCNJ2-genet: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2 [Internet]. [citeret 19. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/kcnj2
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger