Gen
STX11
syntaxin 11
- HGNC 11429↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000135604↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 8676↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 6q24.2
- Souřadnice
- Chromozom 6: 144 150 517–144 191 939 (GRCh38)
- Exony
- 2 exonů na 41,4 kb
- Protein
- 287 aminokyselin
- Transkript MANE Select
- ENST00000367568.5NM_003764.4
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/stx11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si STX11 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Familial Hemophagocytic Lymphohistiocytosis
- Familial hemophagocytic lymphohistiocytosis type 4 (STX11)Autozomálně recesivní
Caused by changes in the STX11 gene, which is involved in the release of killing granules from immune cells.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 3 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Early recognition allows prompt treatment and planning for a stem cell transplant, which is the only cure.
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
Jeden z 114 genů spojených s touto vazbou
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 3 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je STX11 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,5 kb z 41,4 kb genu; 864 těchto bází kódují protein.
Sekvenování STX11
25
pozic v STX11, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 41,4 kb genu STX11, včetně intronů, nikoli jen 5,5 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ADARadenosine deaminase RNA specificSdílí 1 onemocnění
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 1 onemocnění
- AP3B1adaptor related protein complex 3 subunit beta 1Sdílí 1 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 1 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 1 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 1 onemocnění
- BLNKB cell linkerSdílí 1 onemocnění
- BLOC1S6biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 6Sdílí 1 onemocnění
- BTKBruton tyrosine kinaseSdílí 1 onemocnění
- C1QAcomplement C1q A chainSdílí 1 onemocnění
- C1QBcomplement C1q B chainSdílí 1 onemocnění
- C1QCcomplement C1q C chainSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s STX11
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit STX11. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Abnormality of multiple cell lineages in the bone marrow
- Hemophagocytosis
- Hypofibrinogenemia
- Low platelet count
- Abnormality of the coagulation cascade
- Blood spots
- Ecchymosis
Zobrazit ještě 3 rysů
Abnormality of the immune system
- Abnormal circulating cytokine concentration
- Abnormality of tumor necrosis factor secretion
- Immune dysregulation
- Increased circulating interferon-gamma concentration
- Increased circulating interleukin 6 concentration
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Skin rash
- Brain inflammation
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen STX11: syntaxin 11. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/stx11
Dante Labs. Gen STX11: syntaxin 11 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/stx11
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů