Gen
CDH1
cadherin 1
- HGNC 1748↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000039068↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 999↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 16q22.1
- Souřadnice
- Chromozom 16: 68 737 292–68 835 537 (GRCh38)
- Exony
- 16 exonů na 98,2 kb
- Protein
- 882 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Další názvy
- uvomorulin, CD324
- Předchozí symboly
- UVO
- Transkript MANE Select
- ENST00000261769.10NM_004360.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si CDH1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Hereditary Diffuse Gastric Cancer
- CDH1-related diffuse gastric and lobular breast cancer syndromeAutozomálně dominantní
CDH1 variants that raise the lifetime risk of diffuse gastric cancer and lobular breast cancer.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Preventive removal of the stomach is often considered, or intensive endoscopic surveillance as an alternative, with breast MRI for women.
- Hereditary diffuse gastric adenocarcinomaAutozomálně dominantní
Familial clustering of diffuse-type stomach cancer, often caused by CDH1 variants.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Specialist assessment of stomach surgery or endoscopic surveillance.
Breast and Ovarian Cancer Genes Beyond BRCA1/2
- Hereditary breast cancerAutozomálně dominantní
Inherited susceptibility to breast cancer caused by variants in one of several genes.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Earlier and more intensive breast screening, including MRI, may be recommended depending on the gene.
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je CDH1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,8 kb z 98,2 kb genu; 2 649 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte CDH1
517
pozic v genu CDH1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 98,2 kb genu CDH1, včetně intronů, nikoli jen 4,8 kb exonů.
Varianty se stránkou (228)
Varianty genu CDH1 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A530Cfs*7 | c.1587dup | Exon 11 | 68 819 300 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A546Lfs*11 | c.1636del | Exon 11 | 68 819 347 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.1A>G | Exon 1 | 68 737 416 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2T>A | Exon 1 | 68 737 417 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2T>C | Exon 1 | 68 737 417 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2T>G | Exon 1 | 68 737 417 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.3G>A | Exon 1 | 68 737 418 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.11G>A | Exon 1 | 68 737 426 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.48+1G>A | Intron 1 | 68 737 464 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.49-2A>G | Intron 1 | 68 738 295 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
Rysy spojené s CDH1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit CDH1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Distichiasis
- Euryblepharon
- Eyelids stay open
- Flat face
- High forehead
- Lower eyelid folded out
- Abnormality of the eyelid
- Abnormality of tooth eruption
Zobrazit ještě 18 rysů
- Cleft upper lip
- Cleft of the mouth
- Cleft palate
- Cone shaped tooth
- Dental cavities
- One sided cleft palate
- Velopharyngeal incompetence
- Abnormal number of permanent teeth
- Bad bite
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Hole in roof of mouth
- Missing lateral incisor
- Peg-shaped maxillary lateral incisors
- Right and left cleft palate
- Decreased size of maxilla
- High frontal hairline
- Both sided cleft lip
- Failure of development of between one and six teeth
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CDH1: cadherin 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/cdh1
Dante Labs. Gen CDH1: cadherin 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/cdh1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů