Genas
SDHAF2
succinate dehydrogenase complex assembly factor 2
- HGNC 26034↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000167985↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 54949↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 11q12.2
- Koordinatės
- Chromosoma 11: 61 430 124–61 446 733 (GRCh38)
- Eksonai
- 4 eksonų per 16,6 kb
- Baltymas
- 166 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Taip pat žinomas kaip
- FLJ20487, SDH5
- Ankstesni simboliai
- PGL2, C11orf79
- MANE Select transkriptas
- ENST00000301761.7NM_017841.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite SDHAF2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Paveldima feochromocitoma ir paragangliomos
- Paveldima feochromocitoma–paragangliomosAutosominis dominantinis
Sindromų grupė (PPGL 1–7 tipai, susiję su TMEM127 ir MAX), kurioje SDHB, SDHD, SDHC, SDHA, SDHAF2, MAX arba TMEM127 variantai padidina feochromocitomos ir paragangliomos riziką.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 3 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių rezultatų sąrašą
Ką duoda žinojimas
Reguliarus metanefrinų tyrimas kraujyje ar šlapime ir periodinis viso kūno MRT padeda aptikti navikus anksti, dar prieš jiems sukeliant kraujospūdžio krizes; giminaičiams gali būti siūlomas tyrimas.
Endokrininių liaukų piktybinis navikas
Piktybinis navikas, pažeidžiantis endokrinines liaukas. Tipiški pavyzdžiai: skydliaukės karcinoma, prieskydinių liaukų karcinoma, hipofizės karcinoma ir antinksčių žievės karcinoma.
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių rezultatų sąrašą
Šlapimo ir inkstų sistemos navikas
- Šlapimo sistemos neoplazma
Gerybinis arba piktybinis, pirminis arba metastazinis navikas, pažeidžiantis šlapimo sistemą.
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių rezultatų sąrašą
Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Pakanka vieno pakitusio egzemplioriaus iš bet kurio iš tėvų. Tėvas ar motina, turintys tokį pakitimą, perduoda jį kiekvienam vaikui su vienos iš dviejų tikimybe.
Kaip išdėstytas SDHAF2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 1,2 kb iš 16,6 kb geno; 501 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito SDHAF2
59
SDHAF2 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 16,6 kb SDHAF2 geno, įskaitant intronus, o ne tik 1,2 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (14)
Čia pateikiami SDHAF2 variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| c.37-1G>C | Intronas 1 | 61 437 624 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra | |
| c.260+1G>A | Intronas 2 | 61 437 849 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra | |
| c.371-2A>G | Intronas 3 | 61 445 939 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra | |
| F89Lfs*9 | c.267del | Eksonas 3 | 61 438 005 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| G78R | c.232G>A | Eksonas 2 | 61 437 820 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| N103Efs*4 | c.305_306insA | Eksonas 3 | 61 438 048 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| Q56X | c.166C>T | Eksonas 2 | 61 437 754 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| R77Gfs*10 | c.229_230del | Eksonas 2 | 61 437 814 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| S4Lfs*31 | c.9_19del | Eksonas 1 | 61 430 152 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| S8X | c.23C>A | Eksonas 1 | 61 430 169 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit ATuri 3 bendrų būklių
- RETret proto-oncogeneTuri 2 bendrų būklių
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BTuri 2 bendrų būklių
- TP53tumor protein p53Turi 2 bendrų būklių
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Turi 1 bendrą būklę
- CDC73cell division cycle 73Turi 1 bendrą būklę
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Turi 1 bendrą būklę
- FLCNfolliculinTuri 1 bendrą būklę
- MAXMYC associated transcriptional regulator XTuri 1 bendrą būklę
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseTuri 1 bendrą būklę
- PAX6paired box 6Turi 1 bendrą būklę
- SDHCsuccinate dehydrogenase complex subunit CTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su SDHAF2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SDHAF2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SDHAF2 genas: succinate dehydrogenase complex assembly factor 2. Pasiekta 2026 m. spalio 16 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/sdhaf2
Dante Labs. SDHAF2 genas: succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 16 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/sdhaf2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites