Gen
SLC6A8
solute carrier family 6 member 8
- HGNC 11055↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000130821↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6535↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- Xq28
- Współrzędne
- Chromosom X: 153 687 926–153 696 588 (GRCh38)
- Eksony
- 13 eksonów na odcinku 8,7 kb
- Białko
- 635 aminokwasów
- Znany również jako
- CRTR, CT1, CRT, CRT-1, CRT1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000253122.10NM_005629.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj SLC6A8 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Zespoły niedoboru kreatyny w mózgu
- Zespół niedoboru kreatyny w mózgu
Obejmuje niedobór GAMT i AGAT (autosomalnie recesywny) oraz niedobór transportera kreatyny (SLC6A8, sprzężony z chromosomem X), które mogą powodować niepełnosprawność intelektualną, opóźnienie rozwoju mowy, napady padaczkowe i zaburzenia zachowania.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Znajomość wyniku umożliwia suplementację kreatyną, a w przypadku niedoboru GAMT także suplementację ornityną i zmiany w diecie. Przy wczesnym rozpoczęciu leczenia może to poprawić objawy lub zapobiec im w przypadku wad syntezy.
Budowa genu SLC6A8
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 3,9 kb z 8,7 kb genu; 1908 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje SLC6A8
163
pozycje w SLC6A8, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
163 z nich (100%) przypada na regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappability (44 miejsc)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (163 miejsc)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 8,7 kb genu SLC6A8, łącznie z intronami, a nie tylko 3,9 kb eksonów.
Warianty z podstroną (82)
Warianty SLC6A8 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A153Gfs*36 | c.457dup | Ekson 3 | 153 691 364 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A191Qfs*10 | c.570_571del | Ekson 3 | 153 691 476 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A404P | c.1210G>C | Ekson 8 | 153 693 973 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A478Gfs*24 | c.1432dup | Ekson 10 | 153 694 381 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.262_262+1delinsTT | Ekson 1 | 153 688 836 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.262+1G>T | Intron 1 | 153 688 837 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.263-1G>C | Intron 1 | 153 690 374 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.263-2A>G | Intron 1 | 153 690 373 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.778-2A>G | Intron 4 | 153 693 039 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.912G>A | Ekson 5 | 153 693 175 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
Cechy powiązane z genem SLC6A8
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SLC6A8. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Reduced brain creatine level by MRS
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Chorea
Pokaż jeszcze 15 cech
- Dystonia
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- More active than typical
- Self-mutilation
- Speech apraxia
- Wide based walk
- Abnormal gait
- Aggressive behavior
- Attention deficit
- Delayed myelination
- Motor delay
- Poor hand-eye coordination
- Poor social interactions
- Repetitive movements
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Open mouth
- Zygomatic flattening
- Expressionless face
- Big lower jaw
- Broad forehead
- Long face
- Midface retrusion
Pokaż jeszcze 2 cech
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SLC6A8: solute carrier family 6 member 8. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/slc6a8
Dante Labs. Gen SLC6A8: solute carrier family 6 member 8 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/slc6a8
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni