Gen
TCOF1
treacle ribosome biogenesis factor 1
- HGNC 11654↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000070814↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6949↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 5q32-q33.1
- Coördinaten
- Chromosoom 5: 150.357.697–150.400.293 (GRCh38)
- Exons
- 27 exons over 42,6 kb
- Eiwit
- 1.489 aminozuren
- Ook bekend als
- treacle, TCS
- MANE Select-transcript
- ENST00000643257.2NM_001371623.1
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tcof1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees TCOF1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Treacher Collins-syndroom
Een aandoening van de gezichtsontwikkeling (mandibulofaciale dysostose) veroorzaakt door veranderingen in TCOF1, POLR1D, POLR1C of POLR1B, die dominant of, bij sommige genen, recessief overerft; de kenmerken variëren sterk, waardoor licht aangedane ouders vaak niet worden herkend.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Als u hiervan op de hoogte bent, kan dat helpen bij de behandeling van gehoor- en ademhalingsproblemen en bij het bespreken van het herhalingsrisico binnen de familie.
Opbouw van TCOF1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 5 kb van de 42,6 kb van het gen; 4.470 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van TCOF1
163
posities in TCOF1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 42,6 kb van TCOF1, inclusief intronen, en niet alleen de 5 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
Kenmerken gekoppeld aan TCOF1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die TCOF1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of head or neck
- Absent eyelashes
- Cleft lower eyelid
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Little lower jaw
- Abnormal facial shape
- Cheekbone underdevelopment
- Decreased size of maxilla
- Midface retrusion
Toon 36 kenmerken meer
- Open bite
- Receding chin
- Short face
- Zygomatic flattening
- Abnormal dentition
- Bad bite
- Cleft eyelid
- Cleft upper eyelid
- Decreased number of teeth
- Frontal bossing
- Hair growing down to cheek
- Low frontal hairline
- Wide nasal bridge
- Abnormal lacrimal duct morphology
- Abnormal tooth enamel
- Abnormality of dental shape
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Branchial fistula
- Broad head shape
- Cleft of the face
- Cleft palate
- Cleft upper lip
- Coronal craniosynostosis
- Encephalocele
- Eyelid spasm
- High palate
- Lambdoidal craniosynostosis
- Narrow mouth
- Retraction of the tongue
- Skin tag in front of the ear
- Squamosal suture synostosis
- Wide mouth
- Abnormal parotid gland morphology
- Cleft soft palate
- Narrowing of the tear duct
- Sparse lower eyelashes
Abnormality of the eye
- Cat eye
- Cross-eyed
- Visual impairment
- Abnormally small eyeball
- Clouding of the lens of the eye
- Wide-set eyes
- Abnormally small eyeball on both sides
- Drooping upper eyelid
Toon 1 kenmerk meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). TCOF1-gen: treacle ribosome biogenesis factor 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/tcof1
Dante Labs. TCOF1-gen: treacle ribosome biogenesis factor 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/tcof1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken