Genas
RIN2
Ras and Rab interactor 2
- HGNC 18750↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000132669↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 54453↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 20p11.23
- Koordinatės
- Chromosoma 20: 19 758 258–20 002 456 (GRCh38)
- Eksonai
- 13 eksonų per 244,2 kb
- Baltymas
- 895 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- RASSF4
- MANE Select transkriptas
- ENST00000255006.12NM_018993.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rin2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite RIN2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Cutis laxa
Cutis laxa (CL) – tai paveldimas arba įgytas jungiamojo audinio sutrikimas, kuriam būdinga raukšlėta, perteklinė ir nusileidusi neelastinga oda, susijusi su kaulų ir vystymosi anomalijomis, o kai kuriais atvejais – su sunkiu sisteminiu pažeidimu. Aprašytos kelios skirtingos paveldimos CL formos, kurios skiriasi pagal paveldėjimo būdą, vidaus organų pažeidimo mastą, susijusias anomalijas ir ligos sunkumą.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas RIN2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,4 kb iš 244,2 kb geno; 2 688 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: RIN2
2Maža
Kiek sunku sekti RIN2 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo RIN2 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.3,2 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.17 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
2
RIN2 pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 244,2 kb geno RIN2, įskaitant intronus, o ne tik 4,4 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Turi 1 bendrą būklę
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Turi 1 bendrą būklę
- ATP6V1AATPase H+ transporting V1 subunit ATuri 1 bendrą būklę
- ATP6V1E1ATPase H+ transporting V1 subunit E1Turi 1 bendrą būklę
- ATP7AATPase copper transporting alphaTuri 1 bendrą būklę
- EFEMP1EGF-like fibulin extracellular matrix protein 1Turi 1 bendrą būklę
- EFEMP2EGF-like fibulin extracellular matrix protein 2Turi 1 bendrą būklę
- ELNelastinTuri 1 bendrą būklę
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Turi 1 bendrą būklę
- FBLN5fibulin 5Turi 1 bendrą būklę
- GORABgolgin, RAB6 interactingTuri 1 bendrą būklę
- LTBP1latent transforming growth factor beta binding protein 1Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su RIN2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti RIN2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). RIN2 genas: Ras and Rab interactor 2. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/rin2
Dante Labs. RIN2 genas: Ras and Rab interactor 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/rin2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites