Genas
PLOD1
procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1
- HGNC 9081↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000083444↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 5351↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 1p36.22
- Koordinatės
- Chromosoma 1: 11 934 717–11 975 537 (GRCh38)
- Eksonai
- 19 eksonų per 40,8 kb
- Baltymas
- 727 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- LH1
- Ankstesni simboliai
- LLH, PLOD
- MANE Select transkriptas
- ENST00000196061.5NM_000302.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite PLOD1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Ehlers-Danlos sindromas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Kaip išdėstytas PLOD1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 3 kb iš 40,8 kb geno; 2 184 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito PLOD1
95
PLOD1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 40,8 kb PLOD1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 3 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2Turi 1 bendrą būklę
- AEBP1AE binding protein 1Turi 1 bendrą būklę
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 6Turi 1 bendrą būklę
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 7Turi 1 bendrą būklę
- C1Rcomplement C1rTuri 1 bendrą būklę
- C1Scomplement C1sTuri 1 bendrą būklę
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 14Turi 1 bendrą būklę
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL1A2collagen type I alpha 2 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL3A1collagen type III alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL5A1collagen type V alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su PLOD1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti PLOD1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Double-Jointed
- Flattened vertebrae
- Kyphoscoliosis
- Low muscle tone
- Muscle weakness
- Osteopenia
- Thin ribs
- Low muscle tone, in neonatal onset
Rodyti dar 15 savybių
- Osteoporosis
- Thoracic kyphoscoliosis
- Hypermobility of all joints
- Joint dislocation
- Joint subluxation
- Thoracic scoliosis
- Congenital kyphoscoliosis
- Decreased muscle mass
- Distal joint hypermobility
- EMG: myopathic abnormalities
- Funnel chest
- Generalized muscle weakness
- Muscle fiber degeneration
- Partial shoulder dislocation
- Progressive congenital scoliosis
Abnormality of the eye
- Blue outer white part of eyeball
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Drooping upper eyelid
- Close sighted
- Farsightedness
- Glaucoma
- Retinal detachment
- Scleral rupture
Rodyti dar 3 savybių
Abnormality of the integument
- Follicular hyperkeratosis
- Soft skin
- Fragile skin
- Hyperelastic skin
- Sunken or indented skin due to damage
- Poor wound healing
- Widened atrophic scar
- Excessive wrinkled skin
Rodyti dar 2 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). PLOD1 genas: procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/plod1
Dante Labs. PLOD1 genas: procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/plod1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites