Gén
SYNGAP1
synaptic Ras GTPase activating protein 1
- HGNC 11497↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000197283↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 8831↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 6p21.32
- Koordináták
- 6. kromoszóma: 33 420 065–33 453 689 (GRCh38)
- Exonok
- 19 exon, összesen 33,6 kb
- Fehérje
- 1343 aminosav
- Más néven ismert
- SYNGAP, RASA5, KIAA1938
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000646630.1NM_006772.3
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a SYNGAP1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
A 171 hozzá kapcsolódó gén egyike
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Intellectual Disability
A 233 hozzá kapcsolódó gén egyike
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
A SYNGAP1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 33,6 kb-jából 6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4032 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) SYNGAP1 gént
304
pozíció a(z) SYNGAP1 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 304 (100%) olyan régiókba esik, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
- MHC (304 hely)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.
A teljes genom a SYNGAP1 gén mind a 33,6 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 6 kb exonját.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 92 betegséget oszt meg
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 22 betegséget oszt meg
- FGF13fibroblast growth factor 132 betegséget oszt meg
- GRIN1glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 12 betegséget oszt meg
- GRIN2Bglutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B2 betegséget oszt meg
- MECP2methyl-CpG binding protein 22 betegséget oszt meg
- NACC1nucleus accumbens associated 12 betegséget oszt meg
- NUS1NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit2 betegséget oszt meg
- OTUD6BOTU deubiquitinase 6B2 betegséget oszt meg
- PCDH19protocadherin 192 betegséget oszt meg
- SCN2Asodium voltage-gated channel alpha subunit 22 betegséget oszt meg
- SEMA6Bsemaphorin 6B2 betegséget oszt meg
A(z) SYNGAP1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) SYNGAP1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- IQ between 34 and 49
- Motor delay
- Abnormality of pain sensation
- Delayed speech and language development
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Generalized myoclonic-atonic seizure
Még 59 tulajdonság megjelenítése
- Generalized-onset seizure
- Intellectual disability
- Abnormal eating behavior
- Abnormal gait
- Abnormality of coordination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brain degeneration
- Brief seizures with staring spells
- Decreased reflex response
- Difficulty sleeping
- Eating-induced seizure
- EEG with multifocal slow activity
- EEG with polyspike wave complexes
- Epilepsy
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Incoordination
- Intellectual disability, severe
- Lack of peer relationships
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Myoclonic absence seizure
- Poor speech
- Sudden loss of muscle tone
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal emotional state
- Abnormal myelination
- Abnormal subarachnoid space morphology
- Absent speech development
- Autism
- Brain imaging abnormality
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Obsessive-compulsive trait
- Poor social interactions
- Recurrent hand flapping
- Simple febrile seizure
- Tremor
- Unsteady walk
- Abnormal pyramidal sign
- Epileptic encephalopathy
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- EEG abnormality
- Epileptic spasm
- Language impairment
Abnormality of the eye
- Cross-eyed
- Deeply set eye
- Drooping upper eyelid
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal involuntary eye movements
- Abnormality of vision
- Abnormally small eyeball
- Optic atrophy
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). SYNGAP1 gén: synaptic Ras GTPase activating protein 1. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/syngap1
Dante Labs. SYNGAP1 gén: synaptic Ras GTPase activating protein 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/syngap1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt