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Gène

GRIK2

glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2

Résumé

Localisation cytogénétique
6q16.3
Coordonnées
Chromosome 6 : 101 393 708–102 070 083 (GRCh38)
Exons
17 exons sur 676,4 kb
Protéine
908 acides aminés
Aussi appelé
GluK2, MRT6, GluR-6, EAA4, GLUK6
Symboles précédents
GLUR6
Transcrit MANE Select
ENST00000369134.9NM_021956.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    Structure de GRIK2

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de GRIK2. GRIK2 et 1 gène à proximité sur le chromosome 6, de 100 717 332 à 102 746 459.Chromosome 66q16.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27101 Mb101,5 Mb102 Mb102,5 MbASCC3 : 100 508 194–100 881 412, brin inverseASCC3GRIK2 : 101 393 708–102 070 083, brin directGRIK2Schéma de GRIK2 : 17 exons sur le brin direct du chromosome 6Exon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 14 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 101 393 708–101 393 837, 130 basesExon 2 : 101 398 985–101 399 392, 408 basesExon 3 : 101 621 949–101 622 116, 168 basesExon 4 : 101 626 380–101 626 637, 258 basesExon 5 : 101 676 623–101 676 804, 182 basesExon 6 : 101 682 553–101 682 606, 54 basesExon 7 : 101 686 180–101 686 353, 174 basesExon 8 : 101 799 648–101 799 791, 144 basesExon 9 : 101 802 331–101 802 438, 108 basesExon 10 : 101 818 370–101 818 483, 114 basesExon 11 : 101 859 287–101 859 493, 207 basesExon 12 : 101 889 640–101 889 863, 224 basesExon 13 : 101 924 601–101 924 719, 119 basesExon 14 : 101 928 415–101 928 632, 218 basesExon 15 : 102 035 341–102 035 566, 226 basesExon 16 : 102 055 330–102 055 580, 251 basesExon 17 : 102 068 347–102 070 083, 1 737 bases151015175′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 4,7 kb sur les 676,4 kb du gène ; 2 727 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit GRIK2

    5

    positions dans GRIK2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

    Un génome entier couvre les 676,4 kb de GRIK2, introns compris, et pas seulement les 4,7 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène GRIK2 : glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/grik2

    Vancouver

    Dante Labs. Gène GRIK2 : glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/grik2

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