Geeni
CBS
cystathionine beta-synthase
- HGNC 1550↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000160200↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 875↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 21q22.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 21: 43 053 191–43 075 835 (GRCh38)
- Eksonit
- 17 eksonia 22,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 551 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- HIP4
- MANE Select -transkripti
- ENST00000398165.8NM_000071.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue CBS ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Homokystinuria ja kobalamiinin aineenvaihduntahäiriöt
- HomokystinuriaAutosomaalinen resessiivinen
Sisältää CBS-puutokseen liittyvän klassisen homokystinurian, vakavan MTHFR-puutoksen sekä yhdistelmä- ja remetylaatiokobalamiinihäiriöt, jotka voivat aiheuttaa linssin dislokaation, verihyytymiä, luustomuutoksia, anemiaa ja kehityshäiriöitä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tiedon avulla voidaan tarvittaessa aloittaa hoito B6-vitamiinilla, B12-vitamiinilla, folaatilla, betaiinilla ja ruokavaliolla. Hoito voi ehkäistä linssin dislokaation, tromboosin ja muiden komplikaatioiden syntymistä.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
CBS-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,5 kb geenin 22,6 kb:stä; 1 656 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä CBS
179
CBS-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 179 (100 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (179 kohtaa)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (179 kohtaa)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Kokogenomi kattaa kaikki 22,6 kb geenistä CBS, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCD4ATP binding cassette subfamily D member 4Yhteinen sairaus: 1
- HCFC1host cell factor C1Yhteinen sairaus: 1
- LMBRD1LMBR1 domain containing 1Yhteinen sairaus: 1
- MMACHCmetabolism of cobalamin associated CYhteinen sairaus: 1
- MMADHCmetabolism of cobalamin associated DYhteinen sairaus: 1
- MTHFRmethylenetetrahydrofolate reductaseYhteinen sairaus: 1
- MTR5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- MTRR5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductaseYhteinen sairaus: 1
- PRDX1peroxiredoxin 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin CBS liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CBS voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Outward facing eye ball
- Ectopia lentis
- Close sighted
- Lazy eye
- Partially dislocated lens
- Retinal detachment
- Abnormal retinal pigmentation
- Clouding of the lens of the eye
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Osteoporosis
- Recurrent fractures
- Funnel chest
- Hunched back
- Joint stiffness
- Kyphoscoliosis
- Pigeon chest
- Scoliosis
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the cardiovascular system
- Arteriovenous malformation
- Blood clot in artery of lung
- Disruption of blood oxygen supply to brain
- High blood pressure
- Hives
- Livedo reticularis
- Cutis marmorata
- Heart attack
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). CBS-geeni: cystathionine beta-synthase. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cbs
Dante Labs. CBS-geeni: cystathionine beta-synthase [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cbs
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa