Geen
RPE65
retinoid isomerohydrolase RPE65
- HGNC 10294↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000116745↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 6121↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1p31.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 68 428 822–68 449 954 (GRCh38)
- Eksonid
- 14 eksonit, ulatus 21,1 kb
- Valk
- 533 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- LCA2, rd12, BCO3
- Varasemad tähised
- RP20
- MANE Select transkript
- ENST00000262340.6NM_000329.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe RPE65 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Leber'i kaasasündinud amauroos ja RPE65-ga seotud retinopaatia
- RPE65-ga seotud retsessiivne retinopaatiaAutosoomne retsessiivne
Retinaalne düstroofia, mida põhjustavad muutused mõlemas RPE65 koopias. Haigus ulatub Leber'i kaasasündinud amauroosist kuni varajase algusega retinitis pigmentosani.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Inimesed, kellel on kinnitatud biallelilised RPE65 variandid ja piisavalt elujõulisi võrkkesta rakke, võivad olla geeniteraapia (voretigene neparvovec) sihtrühma kuuluvad.
- RPE65-ga seotud dominantne retinopaatiaAutosoomne dominantne
Harvem esinev, hilisema algusega retinaalne düstroofia, mida põhjustab RPE65 üks dominantne muutus.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: tugev
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Regulaarsed silmaarstlikud uuringud aitavad jälgida võrkkesta seisundit ja toetavad madala nägemisega toimetuleku planeerimist.
- Leber'i kaasasündinud amauroosAutosoomne retsessiivne
Päriliku retinaalse düstroofia rühm, mida põhjustavad muutused geenides nagu CEP290, GUCY2D, CRB1, RPE65 ja AIPL1. Haigus põhjustab imikueas raskt nägemiskaotust, nüstagmi ja nõrka pupillireaktsiooni.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Geeni kinnitamine võib määrata, kas teil on õigus geenispetsiifilistele ravimeetoditele ja kliinilistele uuringutele, ning aitab kaasa perenõustamisele.
Laiemad rühmad
Retinitis pigmentosa
Üks 77 sellega seotud geenist
Pärilike võrkkesta düstroofiate rühm, mille puhul toimub varraste ja seejärel kolbide fotoretseptorite progresseeruv kadu, põhjustades öise pimeduse ja järkjärgulise perifeerse nägemise kaotuse.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas RPE65 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,6 kb kogupikkusega 21,1 kb; neist 1602 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse RPE65
304
kohad geenis RPE65, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni RPE65 21,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,6 kb).
Variandid, millel on leht (190)
Siin on RPE65 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A145D | c.434C>A | Ekson 5 | 68 444 592 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A145P | c.433G>C | Ekson 5 | 68 444 593 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A179V | c.536C>T | Ekson 6 | 68 440 960 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A214Sfs*20 | c.639dup | Ekson 6 | 68 440 856 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A360P | c.1078G>C | Ekson 10 | 68 438 237 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A415V | c.1244C>T | Ekson 12 | 68 431 376 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A434E | c.1301C>A | Ekson 12 | 68 431 319 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| c.2T>C | Ekson 1 | 68 449 904 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.11+5G>A | Intron 1 | 68 449 890 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.95-2A>T | Intron 2 | 68 446 862 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- CRB1crumbs cell polarity complex component 1Jagab 2 haigust
- CRXcone-rod homeoboxJagab 2 haigust
- IMPDH1inosine monophosphate dehydrogenase 1Jagab 2 haigust
- PRPH2peripherin 2Jagab 2 haigust
- RDH12retinol dehydrogenase 12Jagab 2 haigust
- ROM1retinal outer segment membrane protein 1Jagab 2 haigust
- SPATA7spermatogenesis associated 7Jagab 2 haigust
- TULP1TUB like protein 1Jagab 2 haigust
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Jagab 1 haigust
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Jagab 1 haigust
- AHRaryl hydrocarbon receptorJagab 1 haigust
- AIPL1AIP like 1 HSP90 co-chaperoneJagab 1 haigust
Geeniga RPE65 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida RPE65 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Undetectable light- and dark-adapted electroretinogram
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
Näita veel 44 tunnust
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Marked vision impairment
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Absent foveal reflex
- Bulging cornea
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Farsightedness
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Retinal pigment epithelial mottling
- Slow pupillary light response
- Undetectable electroretinogram
- Abnormal corneal endothelium morphology
- Atrophic fundus lesion
- Blurred vision
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Granular macular appearance
- Macular pseudocoloboma
- Outward facing eye ball
- Photopsia
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Retinal detachment
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Nummular pigmentation of the retina
- Pigmentary retinopathy
- Rod-cone dystrophy
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RPE65 geen: retinoid isomerohydrolase RPE65. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rpe65
Dante Labs. RPE65 geen: retinoid isomerohydrolase RPE65 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rpe65
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast