Geeni
L1CAM
L1 cell adhesion molecule
- HGNC 6470↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000198910↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3897↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- Xq28
- Koordinaatit
- Kromosomi X: 153 861 516–153 886 173 (GRCh38)
- Eksonit
- 29 eksonia 24,7 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 257 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- CD171, NCAM-L1, CAML1
- Aiemmat symbolit
- HSAS1, SPG1, HSAS, MASA, MIC5, S10
- MANE Select -transkripti
- ENST00000370060.7NM_001278116.2
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue L1CAM ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnöllinen spastinen paraplegia
- Perinnöllinen spastinen paraplegia (kaikki tyypit)
Yksi 66 siihen liittyvästä geenistä
Yhteisnimitys kaikille perinnöllisille spastisille paraplegioille, mukaan lukien SPG4 (SPAST), yleisin dominantti muoto, sekä SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ja SPG31.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
L1CAM-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,1 kb geenin 24,7 kb:stä; 3 774 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä L1CAM
90
L1CAM-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 24,7 kb geenistä L1CAM, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5,1 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Yhteinen sairaus: 1
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseYhteinen sairaus: 1
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Yhteinen sairaus: 1
- AMFRautocrine motility factor receptorYhteinen sairaus: 1
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Yhteinen sairaus: 1
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Yhteinen sairaus: 1
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Yhteinen sairaus: 1
- ATL1atlastin GTPase 1Yhteinen sairaus: 1
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin L1CAM liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita L1CAM voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal gait
- Aqueductal stenosis
- Delayed speech and language development
Näytä 22 piirrettä lisää
- Difficulty finding words
- Epilepsy
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
- Paralysis or weakness of one side of body
- Rise in pressure inside skull
- Cognitive impairment
- Intellectual disability, mild
- IQ between 34 and 49
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Small cerebellum
- Upper motor neuron dysfunction
- Absent septum pellucidum
- Agenesis of corpus callosum
- Ataxia
- Holoprosencephaly
- Mental deterioration
- Corticospinal tract hypoplasia
- Inferior cerebellar vermis hypoplasia
- Interhemispheric cyst
- Leg paralysis
- Shuffled walk
Abnormality of limbs
- Dropped arches
- Thumb contracture
- Hand clenching
- Curvature of little finger
- Dislocated radial head
- Inward turned thumb
- Lower limb muscle weakness
- Permanent flexion of the finger
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). L1CAM-geeni: L1 cell adhesion molecule. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/l1cam
Dante Labs. L1CAM-geeni: L1 cell adhesion molecule [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/l1cam
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa