Γονίδιο
KCNJ10
potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10
- HGNC 6256↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000177807↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 3766↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 1q23.2
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 1: 160.037.467–160.070.160 (GRCh38)
- Εξόνια
- 2 έξώνια σε 32,7 kb
- Πρωτεΐνη
- 379 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- Kir4.1, Kir1.2
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000644903.1NM_002241.5
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Share this page
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnj10.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το KCNJ10, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Δυστονία, Μυοτονία, Παροξυσμική Δυσκινησία
- Παροξυσμική ΔυσκινησίαΑυτοσωμικός επικρατής
Η παροξυσμική δυσκινησία (PD) είναι σπάνια, ετερογενής ομάδα διαταραχών κίνησης που εκδηλώνονται με ανώμαλες ακούσιες κινήσεις, οι οποίες επανέρχονται επεισοδιακά και διαρκούν μόνο λίγο. Η PD περιλαμβάνει την παροξυσμική κινησιογενή δυσκινησία (PKD), την παροξυσμική μη κινησιογενή δυσκινησία (PNKD), την παροξυσμική δυσκινησία που προκαλείται από καταπόνηση (PED) και μια παραλλαγή της PKD, το σύνδρομο ICCA (βρεφικοί σπασμοί και χορεοαθέτωση).
- 1 υποβολέας του GenCC την αξιολογεί ως οριστική ή ισχυρή
- Κληρονομική δυστονία
Γενικός όρος που περιλαμβάνει κληρονομικές δυστονίες, όπως η γενικευμένη δυστονία με έναρξη σε νεαρή ηλικία DYT-TOR1A, η DYT-THAP1, η μυοκλονική δυστονία (SGCE) και η δυστονία που σχετίζεται με το KMT2B.
- 1 υποβολέας του GenCC την αξιολογεί ως οριστική ή ισχυρή
Οικογενής υπομαγνησιαιμία
- Σύνδρομο EAST/SeSAMEΑυτοσωμικός υπολειπόμενος
Αυτοσωμική υπολειπόμενη διαταραχή του KCNJ10 που συνδυάζει επιληψία, αταξία, νευροαισθητήρια κώφωση και νεφρική τubulopathy με απώλεια αλατιού και μαγνησίου.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 5 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Η γνώση της κατάστασης βοηθά στον συντονισμένο νευρολογικό, ακουολογικό και ηλεκτρολυτικό έλεγχο.
Πώς είναι διαταγμένο το KCNJ10
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 5,2 kb από τα 32,7 kb του γονιδίου· 1.140 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχηση του KCNJ10
2Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το KCNJ10 με σύντομα αναγνώσματα, από το 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του KCNJ10 βρίσκονται σε σημεία όπου τα σύντομα αναγνώσματα αντιστοιχίζονται καθαρά.
Τι προσθέτει: το ποσοστό των εξονίων του KCNJ10 σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- ΧαρτογραφησιμότηταΤμήματα όπου αναγνώσματα των 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 100.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παραλόγοι και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κοινό με το chrYΟι ψευδοαυτοσωμικές περιοχές και η περιοχή X-transposed, όπου τα chrX και chrY φέρουν την ίδια ή σχεδόν την ίδια αλληλουχία, οπότε ένα ανάγνωσμα από το ένα μπορεί να τοποθετηθεί στο άλλο. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό σύνθετο γονιδίωμα αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία τα αναγνώσματα μπορούν να ευθυγραμμιστούν. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 50.0%
- ΕπαναλήψειςTandem επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες τα αναγνώσματα ολισθαίνουν και ενδέχεται να μην τις καλύπτουν πλήρως. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 30.3,8%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει αραιά. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 20.2,7%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες δύσκολα αλληλουχούμενων περιοχών Genome in a Bottle του NIST.Πώς βαθμολογείταιΚάθε ράβδος είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του KCNJ10 σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και καθένα επιπλέον προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν βρίσκεται σε κάποια, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται εκεί όπου τα αναγνώσματα δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
24
θέσεις στο KCNJ10 όπου το ClinVar κατατάσσει μια αλλαγή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 32,7 kb του KCNJ10, συμπεριλαμβανομένων των intronic περιοχών, και όχι μόνο τα 5,2 kb των εξονίων.
Παθογόνες παραλλαγές ClinVar (25)
Οι παραλλαγές του KCNJ10 που το ClinVar κατατάσσει ως παθογόνες ή πιθανώς παθογόνες για οποιαδήποτε πάθηση, έχουν αξιολογηθεί από τουλάχιστον έναν υποβάλλοντα με κριτήρια, καθώς και οι πιο αξιολογημένες από αυτές. Είναι η δημόσια καταγραφή του ClinVar για το γονίδιο και σε καμία περίπτωση αποτέλεσμα.
- Παθογόνο 11
- Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο 4
- Πιθανώς παθογόνο 10
| Παραλλαγή | Παθήσεις | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_002241.5(KCNJ10):c.500C>T (p.Ala167Val) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome και 1 ακόμη | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.889C>T (p.Arg297Cys) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome και 1 ακόμη | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.595C>T (p.Arg199Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome και 1 ακόμη | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.179T>C (p.Ile60Thr) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome και 1 ακόμη | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.76C>T (p.Arg26Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome και 1 ακόμη | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.512G>A (p.Arg171Gln) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.193C>T (p.Arg65Cys) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.798dup (p.Asp267fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.331C>T (p.Gln111Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.321_322del (p.Val109fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.305del (p.Pro102fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.236G>A (p.Trp79Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.229G>C (p.Gly77Arg) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.211_212del (p.Phe71fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.198C>G (p.Tyr66Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.68del (p.Pro23fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.19_20insC (p.Val7fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.890G>T (p.Arg297Leu) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.579_585del (p.Lys193fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.581C>A (p.Pro194His) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome και 1 ακόμη | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.523C>T (p.Arg175Trp) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.400C>A (p.Arg134Ser) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.305dup (p.Ala103fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.170C>T (p.Thr57Ile) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_002241.5(KCNJ10):c.-1+1G>T (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | EAST syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- PNKDPNKD metallo-beta-lactamase domain containingΜοιράζεται 2 παθήσεις
- PRRT2proline rich transmembrane protein 2Μοιράζεται 2 παθήσεις
- SLC2A1solute carrier family 2 member 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- TMEM151Atransmembrane protein 151AΜοιράζεται 2 παθήσεις
- ACTBactin betaΜοιράζεται 1 πάθηση
- ANO3anoctamin 3Μοιράζεται 1 πάθηση
- ARFGEF3ARFGEF family member 3Μοιράζεται 1 πάθηση
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Μοιράζεται 1 πάθηση
- BCAP31B cell receptor associated protein 31Μοιράζεται 1 πάθηση
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainΜοιράζεται 1 πάθηση
- DCAF17DDB1 and CUL4 associated factor 17Μοιράζεται 1 πάθηση
- GCH1GTP cyclohydrolase 1Μοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το KCNJ10
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το KCNJ10. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Global developmental delay
- Chorea
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- Epilepsy
- Generalized-onset seizure
- Intellectual disability
Εμφάνιση 19 ακόμη χαρακτηριστικών
- Involuntary movements
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Salt craving
- Action tremor
- Degeneration of cerebellum
- Extreme thirst
- Focal sensory seizure
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Absent speech development
- Inability to walk
- Migraine
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral hypomyelination
- Writer's cramp
- Chronic axonal neuropathy
- Delayed speech and language development
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Intention tremor
Laboratory abnormality
- Elevated serum bicarbonate concentration
- Hypokalemic metabolic alkalosis
- Loss of salt in urine
- Low blood magnesium levels
- Low blood potassium levels
- Renal potassium wasting
- Renal sodium wasting
- Abnormal urinary electrolyte concentration
Εμφάνιση 4 ακόμη χαρακτηριστικών
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-19: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.19-9814e911.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο KCNJ10: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10. Ανάκτηση 21 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/kcnj10
Dante Labs. Γονίδιο KCNJ10: potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10 [Internet]. [ανακτήθηκε 21 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/kcnj10
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες