Γονίδιο
DNASE1L3
deoxyribonuclease 1L3
- HGNC 2959↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000163687↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 1776↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 3p14.3
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 3: 58.192.257–58.210.972 (GRCh38)
- Εξόνια
- 8 έξώνια σε 18,7 kb
- Πρωτεΐνη
- 305 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- DNAS1L3, LSD, D3
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000394549.7NM_004944.4
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dnase1l3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το DNASE1L3, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Αυτοάνοση νόσος
Διαταραχή που προκαλείται από απώλεια λειτουργίας ή καταστροφή ιστού ενός οργάνου ή πολλών οργάνων, η οποία προέρχεται από humoral ή κυτταρικές ανοσολογικές αποκρίσεις του οργανισμού έναντι των δικών του ιστικών συστατικών. Μπορεί να είναι συστημική (π.χ. συστηματικός ερυθηματώδης λύκος) ή ειδική για όργανο (π.χ. θυρεοειδίτιδα).
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 3 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
Συστηματικός Ερυθηματώδης Λύκος
Αυτοάνοσο νόσημα πολλαπλών οργάνων που συνήθως σχετίζεται με αγγειοπάθεια και παραγωγή αυτοαντισωμάτων. Οι περισσότεροι ασθενείς έχουν αντιπυρηνικά αντισώματα (ANA). Η παρουσία αντι-dsDNA ή αντι-Smith αντισωμάτων είναι πολύ ειδική.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 3 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Τυπικός SLE: υδροξυχλωροκίνη, μυκοφαινολάτη, belimumab, anifrolumab· Λύκος με έλλειψη συμπληρώματος: υποκατάσταση με νωπό κατεψυγμένο πλάσμα· Ιντερφερονοπάθεια: anifrolumab, αναστολείς JAK· Για όλους: προστασία από τον ήλιο, διαχείριση καρδιαγγειακού κινδύνου, προγραμματισμός εγκυμοσύνης
Πώς είναι διαταγμένο το DNASE1L3
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 1,4 kb από τα 18,7 kb του γονιδίου· 918 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχιση DNASE1L3
0Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το DNASE1L3 με σύντομες αναγνώσεις, σε κλίμακα από 0 έως 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του DNASE1L3 βρίσκονται σε σημεία όπου οι σύντομες αναγνώσεις αντιστοιχίζονται καθαρά.
Με ό,τι προστίθεται: το ποσοστό των εξονίων του DNASE1L3 σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- Δυνατότητα τοποθέτησηςΤμήματα όπου αναγνώσεις 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Βάρος 100%.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παράλογα γονίδια και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Βάρος 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Βάρος 60%.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό τμήμα του συναρμολογημένου γονιδιώματος αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία να ευθυγραμμίζονται οι αναγνώσεις. Βάρος 50%.0%
- ΕπαναλήψειςΔιαδοχικές επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες οι αναγνώσεις γλιστρούν και ίσως δεν τις καλύπτουν πλήρως. Βάρος 30%.0%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει ελλιπώς. Βάρος 20%.0%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες NIST Genome in a Bottle για δύσκολα προς αλληλούχιση περιοχές.Πώς υπολογίζεταιΚάθε μπάρα είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του DNASE1L3 που βρίσκονται σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε μεμονωμένο είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και κάθε επιπλέον είδος προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν ανήκει σε κάποιο, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται σε περιοχή όπου οι αναγνώσεις δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
8
θέσεις στο DNASE1L3 όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνες ή πιθανώς παθογόνες
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που οι σύντομες αναγνώσεις δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 18,7 kb του DNASE1L3, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 1,4 kb των εξονίων.
ClinVar pathogenic variants (8)
The DNASE1L3 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Παθογόνο 2
- Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο 2
- Πιθανώς παθογόνο 4
| Παραλλαγή | Conditions | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_004944.4(DNASE1L3):c.643del (p.Trp215fs) (opens in a new tab) | autosomal systemic lupus erythematosus type 16 | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_004944.4(DNASE1L3):c.317del (p.Tyr106fs) (opens in a new tab) | autosomal systemic lupus erythematosus type 16 | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_004944.4(DNASE1L3):c.290_291del (p.Thr97fs) (opens in a new tab) | autosomal systemic lupus erythematosus type 16 | Παθογόνο/πιθανώς παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_004944.4(DNASE1L3):c.572A>G (p.Asn191Ser) (opens in a new tab) | autosomal systemic lupus erythematosus type 16 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_004944.4(DNASE1L3):c.805del (p.Leu269fs) (opens in a new tab) | autosomal systemic lupus erythematosus type 16 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_004944.4(DNASE1L3):c.537G>A (p.Trp179Ter) (opens in a new tab) | autosomal systemic lupus erythematosus type 16 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_004944.4(DNASE1L3):c.441dup (p.Asp148fs) (opens in a new tab) | autosomal systemic lupus erythematosus type 16 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_004944.4(DNASE1L3):c.159_172del (p.Ile54fs) (opens in a new tab) | autosomal systemic lupus erythematosus type 16 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- C1QAcomplement C1q A chainΜοιράζεται 2 παθήσεις
- PRKCDprotein kinase C deltaΜοιράζεται 2 παθήσεις
- SAT1spermidine/spermine N1-acetyltransferase 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- TREX1three prime repair exonuclease 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- UNC93B1unc-93B1 regulator of TLR signalingΜοιράζεται 2 παθήσεις
- AIREautoimmune regulatorΜοιράζεται 1 πάθηση
- ATP2C1ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- CASP10caspase 10Μοιράζεται 1 πάθηση
- CASP8caspase 8Μοιράζεται 1 πάθηση
- CBLBCbl proto-oncogene BΜοιράζεται 1 πάθηση
- CHRNGcholinergic receptor nicotinic gamma subunitΜοιράζεται 1 πάθηση
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4Μοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το DNASE1L3
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το DNASE1L3. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Decreased circulating complement C3 concentration
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Systemic lupus erythematosus
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Reduced circulating complement concentration
- Skin rash
- Autoimmunity
Εμφάνιση 4 ακόμη χαρακτηριστικών
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-19: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.19-9814e911.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο DNASE1L3: deoxyribonuclease 1L3. Ανάκτηση 19 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/dnase1l3
Dante Labs. Γονίδιο DNASE1L3: deoxyribonuclease 1L3 [Internet]. [ανακτήθηκε 19 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/dnase1l3
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες