Gen
RUNX1
RUNX family transcription factor 1
- HGNC 10471↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000159216↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 861↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 21q22.12
- Souřadnice
- Chromozom 21: 34 787 801–35 049 302 (GRCh38)
- Exony
- 9 exonů na 261,5 kb
- Protein
- 480 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Další názvy
- PEBP2A2, AMLCR1
- Předchozí symboly
- AML1, CBFA2
- Transkript MANE Select
- ENST00000675419.1NM_001754.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si RUNX1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Inherited Thrombocytopenias
- Hereditary Thrombocytopenia with Blood Cancer PredispositionAutozomálně dominantní
A dominant group of conditions, including RUNX1 familial platelet disorder, in which a low platelet count or poorly working platelets come with an increased lifetime risk of myeloid blood cancers such as myelodysplastic syndrome and acute myeloid leukaemia.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing about it supports regular blood count monitoring, and relatives offered as stem cell donors can be tested before donation.
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je RUNX1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 6 kb z 261,5 kb genu; 1 443 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte RUNX1
184
pozic v genu RUNX1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 261,5 kb genu RUNX1, včetně intronů, nikoli jen 6 kb exonů.
Varianty se stránkou (219)
Varianty genu RUNX1 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A63Gfs*76 | c.184_187dup | Exon 4 | 34 887 006 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A65Rfs*73 | c.191_192insA | Exon 4 | 34 887 002 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A65Vfs*82 | c.166_193dup | Exon 4 | 34 887 000 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A83Gfs*55 | c.247dup | Exon 4 | 34 886 946 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A120Gfs*18 | c.356dup | Exon 5 | 34 880 708 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A134P | c.400G>C | Exon 5 | 34 880 665 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A134Qfs*2 | c.400_404del | Exon 5 | 34 880 660 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A134T | c.400G>A | Exon 5 | 34 880 665 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A134V | c.401C>T | Exon 5 | 34 880 664 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A142Gfs*2 | c.424dup | Exon 5 | 34 880 640 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
Rysy spojené s RUNX1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit RUNX1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormal dense granule content
- Acute monocytic leukemia
- Blood spots
- Ecchymosis
- Impaired ADP-induced platelet aggregation
- Impaired arachidonic acid-induced platelet aggregation
- Impaired collagen-induced platelet aggregation
- Impaired platelet aggregation
Zobrazit ještě 23 rysů
- Low platelet count
- Myeloproliferative disorder
- Petechiae
- Prolonged bleeding time
- Abnormal mast cell morphology
- Abnormal basophil morphology
- Abnormal granulocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Elevated white blood count
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Increased number of platelets in blood
- Acute myeloid leukemia
- Blood cancer
- Blood tumor
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Abnormal alpha granule content
- Bloody nose
- Bruising susceptibility
- Cancer of lymphatic system
- Myelodysplasia
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen RUNX1: RUNX family transcription factor 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/runx1
Dante Labs. Gen RUNX1: RUNX family transcription factor 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/runx1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů