Geen
RUNX1
RUNX family transcription factor 1
- HGNC 10471↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000159216↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 861↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 21q22.12
- Koordinaadid
- Kromosoom 21: 34 787 801–35 049 302 (GRCh38)
- Eksonid
- 9 eksonit, ulatus 261,5 kb
- Valk
- 480 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- Tuntud ka kui
- PEBP2A2, AMLCR1
- Varasemad tähised
- AML1, CBFA2
- MANE Select transkript
- ENST00000675419.1NM_001754.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe RUNX1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Ererditarne trombotsütopeeniad
- Pärilik trombotsütopeenia koos vereloome vähi eelsoodumusegaAutosoomne dominantne
Domineeriv haiguste rühm, sealhulgas RUNX1 perekondlik trombotsüütide häire, mille korral madal trombotsüütide arv või halvasti toimivad trombotsüüdid kaasnevad suurenenud eluaegse riskiga müeloidsete vereloome vähkide, nagu müelodüsplaatiline sündroom ja äge müeloidne leukeemia, tekkeks.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Selle teadmine toetab regulaarset vereanalüüside jälgimist ning sugulasi, keda pakutakse kõrvaldoonoriks, saab enne doonorluse andmist testida.
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas RUNX1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 6 kb kogupikkusega 261,5 kb; neist 1443 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse RUNX1
184
kohad geenis RUNX1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni RUNX1 261,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (6 kb).
Variandid, millel on leht (219)
Siin on RUNX1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A63Gfs*76 | c.184_187dup | Ekson 4 | 34 887 006 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A65Rfs*73 | c.191_192insA | Ekson 4 | 34 887 002 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A65Vfs*82 | c.166_193dup | Ekson 4 | 34 887 000 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A83Gfs*55 | c.247dup | Ekson 4 | 34 886 946 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A120Gfs*18 | c.356dup | Ekson 5 | 34 880 708 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A134P | c.400G>C | Ekson 5 | 34 880 665 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A134Qfs*2 | c.400_404del | Ekson 5 | 34 880 660 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A134T | c.400G>A | Ekson 5 | 34 880 665 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A134V | c.401C>T | Ekson 5 | 34 880 664 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A142Gfs*2 | c.424dup | Ekson 5 | 34 880 640 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
Geeniga RUNX1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida RUNX1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormal dense granule content
- Acute monocytic leukemia
- Blood spots
- Ecchymosis
- Impaired ADP-induced platelet aggregation
- Impaired arachidonic acid-induced platelet aggregation
- Impaired collagen-induced platelet aggregation
- Impaired platelet aggregation
Näita veel 23 tunnust
- Low platelet count
- Myeloproliferative disorder
- Petechiae
- Prolonged bleeding time
- Abnormal mast cell morphology
- Abnormal basophil morphology
- Abnormal granulocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Elevated white blood count
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Increased number of platelets in blood
- Acute myeloid leukemia
- Blood cancer
- Blood tumor
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Abnormal alpha granule content
- Bloody nose
- Bruising susceptibility
- Cancer of lymphatic system
- Myelodysplasia
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RUNX1 geen: RUNX family transcription factor 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/runx1
Dante Labs. RUNX1 geen: RUNX family transcription factor 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/runx1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast