Geeni
RUNX1
RUNX family transcription factor 1
- HGNC 10471↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000159216↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 861↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 21q22.12
- Koordinaatit
- Kromosomi 21: 34 787 801–35 049 302 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 261,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 480 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- PEBP2A2, AMLCR1
- Aiemmat symbolit
- AML1, CBFA2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000675419.1NM_001754.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue RUNX1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnölliset trombosytopeniat
- Perinnöllinen trombosytopenia ja alttius verisyövälleAutosomaalinen dominantti
Dominanttisesti periytyvä sairausryhmä, johon kuuluu RUNX1-perheellinen verihiutalehäiriö. Siihen liittyy matala verihiutaleiden määrä tai heikosti toimivat verihiutaleet, ja elinaikainen riski sairastua myeloidisiin verisyöpiin, kuten myelodysplastiseen oireyhtymään ja akuuttiin myeloiseen leukemiaan, on kohonnut.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tiedossa oleva sairaus tukee säännöllistä verenkuvan seurantaa. Sukulaiset, joita tarjotaan kantasolludonoreiksi, voidaan testata ennen luovutusta.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
RUNX1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 6 kb geenin 261,5 kb:stä; 1 443 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä RUNX1
184
RUNX1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 261,5 kb geenistä RUNX1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 6 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (219)
Tässä ovat RUNX1-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A63Gfs*76 | c.184_187dup | Eksoni 4 | 34 887 006 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A65Rfs*73 | c.191_192insA | Eksoni 4 | 34 887 002 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A65Vfs*82 | c.166_193dup | Eksoni 4 | 34 887 000 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A83Gfs*55 | c.247dup | Eksoni 4 | 34 886 946 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A120Gfs*18 | c.356dup | Eksoni 5 | 34 880 708 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A134P | c.400G>C | Eksoni 5 | 34 880 665 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A134Qfs*2 | c.400_404del | Eksoni 5 | 34 880 660 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A134T | c.400G>A | Eksoni 5 | 34 880 665 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A134V | c.401C>T | Eksoni 5 | 34 880 664 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A142Gfs*2 | c.424dup | Eksoni 5 | 34 880 640 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
Geeniin RUNX1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita RUNX1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormal dense granule content
- Acute monocytic leukemia
- Blood spots
- Ecchymosis
- Impaired ADP-induced platelet aggregation
- Impaired arachidonic acid-induced platelet aggregation
- Impaired collagen-induced platelet aggregation
- Impaired platelet aggregation
Näytä 23 piirrettä lisää
- Low platelet count
- Myeloproliferative disorder
- Petechiae
- Prolonged bleeding time
- Abnormal mast cell morphology
- Abnormal basophil morphology
- Abnormal granulocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Elevated white blood count
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Increased number of platelets in blood
- Acute myeloid leukemia
- Blood cancer
- Blood tumor
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Abnormal alpha granule content
- Bloody nose
- Bruising susceptibility
- Cancer of lymphatic system
- Myelodysplasia
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RUNX1-geeni: RUNX family transcription factor 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/runx1
Dante Labs. RUNX1-geeni: RUNX family transcription factor 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/runx1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa