Gen
RUNX1
RUNX family transcription factor 1
- HGNC 10471↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000159216↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 861↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 21q22.12
- Koordinater
- Kromosom 21: 34 787 801–35 049 302 (GRCh38)
- Eksoner
- 9 eksoner over 261,5 kb
- Protein
- 480 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal dominant
- Også kjent som
- PEBP2A2, AMLCR1
- Tidligere symboler
- AML1, CBFA2
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000675419.1NM_001754.5
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les RUNX1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Arvelig trombocytopeni
- Arvelig trombocytopeni med predisposisjon for blodkreftAutosomal dominant
En gruppe tilstander med dominant arvegang, inkludert RUNX1-familiær blodplatelidelse, der lavt antall blodplater eller dårlig blodplatefunksjon følges av økt livstidsrisiko for myeloide blodkreftformer som myelodysplastisk syndrom og akutt myeloid leukemi.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 6 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Kunnskap om tilstanden gjør det mulig med jevnlig kontroll av blodverdiene, og slektninger som tilbys å bli stamcellegivere, kan testes før donasjon.
Arv
- Autosomal dominant
- Én endret kopi, fra enten forelder, er nok. En forelder som har én, gir den videre til hvert barn med en sjanse på én av to.
Slik er RUNX1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 6 kb av genets 261,5 kb, og 1 443 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test RUNX1
184
posisjoner i RUNX1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 261,5 kb av RUNX1, inkludert introner, og ikke bare de 6 kb med eksoner.
Varianter med egen side (219)
De RUNX1-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A63Gfs*76 | c.184_187dup | Ekson 4 | 34 887 006 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A65Rfs*73 | c.191_192insA | Ekson 4 | 34 887 002 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A65Vfs*82 | c.166_193dup | Ekson 4 | 34 887 000 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A83Gfs*55 | c.247dup | Ekson 4 | 34 886 946 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A120Gfs*18 | c.356dup | Ekson 5 | 34 880 708 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A134P | c.400G>C | Ekson 5 | 34 880 665 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A134Qfs*2 | c.400_404del | Ekson 5 | 34 880 660 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A134T | c.400G>A | Ekson 5 | 34 880 665 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A134V | c.401C>T | Ekson 5 | 34 880 664 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A142Gfs*2 | c.424dup | Ekson 5 | 34 880 640 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme tilstandene
Egenskaper knyttet til RUNX1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene RUNX1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormal dense granule content
- Acute monocytic leukemia
- Blood spots
- Ecchymosis
- Impaired ADP-induced platelet aggregation
- Impaired arachidonic acid-induced platelet aggregation
- Impaired collagen-induced platelet aggregation
- Impaired platelet aggregation
Vis 23 egenskaper til
- Low platelet count
- Myeloproliferative disorder
- Petechiae
- Prolonged bleeding time
- Abnormal mast cell morphology
- Abnormal basophil morphology
- Abnormal granulocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Elevated white blood count
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Increased number of platelets in blood
- Acute myeloid leukemia
- Blood cancer
- Blood tumor
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Abnormal alpha granule content
- Bloody nose
- Bruising susceptibility
- Cancer of lymphatic system
- Myelodysplasia
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). RUNX1-genet: RUNX family transcription factor 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/runx1
Dante Labs. RUNX1-genet: RUNX family transcription factor 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/runx1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker