Gen
HCN1
hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1
- HGNC 4845↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000164588↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 348980↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 5p12
- Souřadnice
- Chromozom 5: 45 254 948–45 696 380 (GRCh38)
- Exony
- 8 exonů na 441,4 kb
- Protein
- 890 aminokyselin
- Další názvy
- BCNG-1, HAC-2
- Předchozí symboly
- BCNG1
- Transkript MANE Select
- ENST00000303230.6NM_021072.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si HCN1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
Jeden z 171 genů spojených s touto vazbou
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je HCN1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 9,9 kb z 441,4 kb genu; 2 673 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte HCN1
14
pozic v genu HCN1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 441,4 kb genu HCN1, včetně intronů, nikoli jen 9,9 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseSdílí 1 onemocnění
- ACTL6Bactin like 6BSdílí 1 onemocnění
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Sdílí 1 onemocnění
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Sdílí 1 onemocnění
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorSdílí 1 onemocnění
- ARXaristaless related homeoboxSdílí 1 onemocnění
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Sdílí 1 onemocnění
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s HCN1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit HCN1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Brief seizures with staring spells
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Encephalopathy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Generalized-onset seizure
- Abnormality of coordination
- Ataxia
Zobrazit ještě 43 rysů
- Autism spectrum disorder
- Clonic seizure
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- EEG with multifocal slow activity
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Loss of developmental milestones
- Myoclonic seizure
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Absent speech development
- Attention deficit
- Atypical absence status epilepticus
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Cognitive impairment
- Cortical dysplasia
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with spike-wave complexes
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Generalized myoclonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Incoordination
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Poor fine motor coordination
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Unsteady walk
- Anxiety
- Focal impaired awareness seizure
- Obsessive-compulsive trait
- Slow movements
- Epileptic encephalopathy
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen HCN1: hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/hcn1
Dante Labs. Gen HCN1: hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/hcn1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů