Gen
HCN1
hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1
- HGNC 4845↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000164588↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 348980↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 5p12
- Coördinaten
- Chromosoom 5: 45.254.948–45.696.380 (GRCh38)
- Exons
- 8 exons over 441,4 kb
- Eiwit
- 890 aminozuren
- Ook bekend als
- BCNG-1, HAC-2
- Eerdere symbolen
- BCNG1
- MANE Select-transcript
- ENST00000303230.6NM_021072.4
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hcn1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees HCN1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Epilepsie (volledig panel)
- Epilepsie
Een van 171 genen die hiermee verband houden
Een hersenaandoening die wordt gekenmerkt door episodes van abnormaal verhoogde neuronale ontlading, die leiden tot tijdelijke episodes van sensorische of motorische neurologische stoornissen, of psychische stoornissen. Deze episodes kunnen al dan niet gepaard gaan met bewustzijnsverlies of convulsies.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van HCN1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 9,9 kb van de 441,4 kb van het gen; 2.673 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van HCN1
14
posities in HCN1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 441,4 kb van HCN1, inclusief intronen, en niet alleen de 9,9 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deelt 1 aandoening
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDeelt 1 aandoening
- ACTL6Bactin like 6BDeelt 1 aandoening
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Deelt 1 aandoening
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Deelt 1 aandoening
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeelt 1 aandoening
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Deelt 1 aandoening
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deelt 1 aandoening
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDeelt 1 aandoening
- ARXaristaless related homeoboxDeelt 1 aandoening
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Deelt 1 aandoening
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan HCN1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die HCN1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Brief seizures with staring spells
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Encephalopathy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Generalized-onset seizure
- Abnormality of coordination
- Ataxia
Toon 43 kenmerken meer
- Autism spectrum disorder
- Clonic seizure
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- EEG with multifocal slow activity
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Loss of developmental milestones
- Myoclonic seizure
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Absent speech development
- Attention deficit
- Atypical absence status epilepticus
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Cognitive impairment
- Cortical dysplasia
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with spike-wave complexes
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Generalized myoclonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Incoordination
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Poor fine motor coordination
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Unsteady walk
- Anxiety
- Focal impaired awareness seizure
- Obsessive-compulsive trait
- Slow movements
- Epileptic encephalopathy
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). HCN1-gen: hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/hcn1
Dante Labs. HCN1-gen: hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/hcn1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken