Geeni
HCN1
hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1
- HGNC 4845↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000164588↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 348980↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 5p12
- Koordinaatit
- Kromosomi 5: 45 254 948–45 696 380 (GRCh38)
- Eksonit
- 8 eksonia 441,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 890 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- BCNG-1, HAC-2
- Aiemmat symbolit
- BCNG1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000303230.6NM_021072.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue HCN1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Epilepsia (laaja paneeli)
- Epilepsia
Yksi 171 siihen liittyvästä geenistä
Aivosairaus, jolle on tyypillistä hermosolujen epänormaalin voimakkaan purkautumisen aiheuttamat jaksot. Ne aiheuttavat ohimeneviä aistihermoston tai motoriikan neurologisia toimintahäiriöitä tai psyykkisiä toimintahäiriöitä. Jaksoihin voi liittyä tajunnan menetys tai kouristuksia, mutta näin ei aina ole.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
HCN1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 9,9 kb geenin 441,4 kb:stä; 2 673 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä HCN1
14
HCN1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 441,4 kb geenistä HCN1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 9,9 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseYhteinen sairaus: 1
- ACTL6Bactin like 6BYhteinen sairaus: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Yhteinen sairaus: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Yhteinen sairaus: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitYhteinen sairaus: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Yhteinen sairaus: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Yhteinen sairaus: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorYhteinen sairaus: 1
- ARXaristaless related homeoboxYhteinen sairaus: 1
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Yhteinen sairaus: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Yhteinen sairaus: 1
Geeniin HCN1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita HCN1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Brief seizures with staring spells
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Encephalopathy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Generalized-onset seizure
- Abnormality of coordination
- Ataxia
Näytä 43 piirrettä lisää
- Autism spectrum disorder
- Clonic seizure
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- EEG with multifocal slow activity
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Loss of developmental milestones
- Myoclonic seizure
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Absent speech development
- Attention deficit
- Atypical absence status epilepticus
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Cognitive impairment
- Cortical dysplasia
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with spike-wave complexes
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Generalized myoclonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Incoordination
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Poor fine motor coordination
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Unsteady walk
- Anxiety
- Focal impaired awareness seizure
- Obsessive-compulsive trait
- Slow movements
- Epileptic encephalopathy
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). HCN1-geeni: hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hcn1
Dante Labs. HCN1-geeni: hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hcn1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa