Gen
CHSY1
chondroitin sulfate synthase 1
- HGNC 17198↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000131873↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 22856↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 15q26.3
- Souřadnice
- Chromozom 15: 101 175 727–101 252 048 (GRCh38)
- Exony
- 3 exonů na 76,3 kb
- Protein
- 802 aminokyselin
- Další názvy
- KIAA0990, CSS1
- Transkript MANE Select
- ENST00000254190.4NM_014918.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si CHSY1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Congenital Disorders of Glycosylation
- Congenital Disorders of Glycosylation (CDG)
Jeden z 98 genů spojených s touto vazbou
A large group of inherited conditions in which sugar chains (glycans) are not correctly built or attached to proteins and lipids, often affecting the brain, liver, blood clotting, growth and many other body systems. Most are autosomal recessive, but some are X-linked or autosomal dominant.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je CHSY1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,7 kb z 76,3 kb genu; 2 409 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte CHSY1
2
pozic v genu CHSY1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 76,3 kb genu CHSY1, včetně intronů, nikoli jen 4,7 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Sdílí 1 onemocnění
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s CHSY1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit CHSY1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of limbs
- Curvature of digit
- Hitchhiker thumb
- Webbed fingers or toes
- Abnormality of fingers or toes
- Duplication of thumb phalanx
- Complete duplication of the innermost bone of the thumb
- Complete duplication of the middle bone of the middle finger
- Fused innermost hinge joints
Zobrazit ještě 18 rysů
- Partial duplication of the proximal bone of the middle finger
- Partial duplication of the thumb bones
- Short fingers or toes
- Curvature of index finger
- Curvature of little finger
- Fused ankle bones
- Fused forearm bones
- Proximal radio-ulnar synostosis
- Radial deviation of finger
- Short big toe
- Short foot
- Short palm
- Tibial deviation of the 2nd toe
- Tibial deviation of the 5th toe
- Webbed fingers
- Fused wrist bones
- Short long bone of foot
- Shortened long bone of hand
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CHSY1: chondroitin sulfate synthase 1. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/chsy1
Dante Labs. Gen CHSY1: chondroitin sulfate synthase 1 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/chsy1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů