Genas
CHSY1
chondroitin sulfate synthase 1
- HGNC 17198↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000131873↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 22856↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 15q26.3
- Koordinatės
- Chromosoma 15: 101 175 727–101 252 048 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 76,3 kb
- Baltymas
- 802 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- KIAA0990, CSS1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000254190.4NM_014918.5
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite CHSY1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Kongenitalinės glikozilinimo sutrikimai
- Kongenitalinės glikozilinimo sutrikimai (CDG)
Vienas iš 98 su juo susijusių genų
Didelė paveldimų ligų grupė, kai cukraus grandinės (glikanai) netinkamai susidaro arba netinkamai prisijungia prie baltymų ir lipidų, dažnai pažeidžiančios smegenis, kepenis, kraujo krešėjimą, augimą ir daugelį kitų organų sistemų. Dauguma yra autosominiu recesyviniu būdu paveldimi, tačiau kai kurios yra X chromosomos susietos arba autosominiu dominantiniu būdu paveldimos.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 3 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Kaip išdėstytas CHSY1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,7 kb iš 76,3 kb geno; 2 409 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito CHSY1
2
CHSY1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 76,3 kb CHSY1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 4,7 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Turi 1 bendrą būklę
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitTuri 1 bendrą būklę
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitTuri 1 bendrą būklę
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su CHSY1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti CHSY1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of limbs
- Curvature of digit
- Hitchhiker thumb
- Webbed fingers or toes
- Abnormality of fingers or toes
- Duplication of thumb phalanx
- Complete duplication of the innermost bone of the thumb
- Complete duplication of the middle bone of the middle finger
- Fused innermost hinge joints
Rodyti dar 18 savybių
- Partial duplication of the proximal bone of the middle finger
- Partial duplication of the thumb bones
- Short fingers or toes
- Curvature of index finger
- Curvature of little finger
- Fused ankle bones
- Fused forearm bones
- Proximal radio-ulnar synostosis
- Radial deviation of finger
- Short big toe
- Short foot
- Short palm
- Tibial deviation of the 2nd toe
- Tibial deviation of the 5th toe
- Webbed fingers
- Fused wrist bones
- Short long bone of foot
- Shortened long bone of hand
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). CHSY1 genas: chondroitin sulfate synthase 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/chsy1
Dante Labs. CHSY1 genas: chondroitin sulfate synthase 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/chsy1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites