Gen
CHSY1
chondroitin sulfate synthase 1
- HGNC 17198↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000131873↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 22856↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 15q26.3
- Koordinater
- Kromosom 15: 101.175.727–101.252.048 (GRCh38)
- Exoner
- 3 exoner fordelt over 76,3 kb
- Protein
- 802 aminosyrer
- Også kendt som
- KIAA0990, CSS1
- MANE Select-transkript
- ENST00000254190.4NM_014918.5
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs CHSY1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Medfødte glykosyleringsforstyrrelser
- Medfødte glykosyleringsforstyrrelser (CDG)
Et af 98 gener, der er knyttet til det
En stor gruppe arvelige tilstande, hvor sukkerkæder (glykaner) ikke dannes eller sættes korrekt på proteiner og lipider. De rammer ofte hjernen, leveren, blodets evne til at størkne, væksten og mange andre organsystemer. De fleste nedarves autosomalt recessivt, men nogle er X-bundne eller autosomalt dominante.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er CHSY1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 4,7 kb af genets 76,3 kb; 2.409 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest CHSY1
2
positioner i CHSY1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 76,3 kb af CHSY1, inklusive introner, og ikke kun de 4,7 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Deler 1 sygdom
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 sygdom
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 sygdom
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 1 sygdom
Træk knyttet til CHSY1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, CHSY1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of limbs
- Curvature of digit
- Hitchhiker thumb
- Webbed fingers or toes
- Abnormality of fingers or toes
- Duplication of thumb phalanx
- Complete duplication of the innermost bone of the thumb
- Complete duplication of the middle bone of the middle finger
- Fused innermost hinge joints
Vis 18 træk mere
- Partial duplication of the proximal bone of the middle finger
- Partial duplication of the thumb bones
- Short fingers or toes
- Curvature of index finger
- Curvature of little finger
- Fused ankle bones
- Fused forearm bones
- Proximal radio-ulnar synostosis
- Radial deviation of finger
- Short big toe
- Short foot
- Short palm
- Tibial deviation of the 2nd toe
- Tibial deviation of the 5th toe
- Webbed fingers
- Fused wrist bones
- Short long bone of foot
- Shortened long bone of hand
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). CHSY1-genet: chondroitin sulfate synthase 1. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/chsy1
Dante Labs. CHSY1-genet: chondroitin sulfate synthase 1 [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/chsy1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger