Gene
MYO5A
myosin VA
- HGNC 7602↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000197535↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 4644↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 15q21.2
- Coordenadas
- Cromossoma 15: 52 307 283–52 528 880 (GRCh38)
- Exões
- 42 exões ao longo de 221,6 kb
- Proteína
- 1880 aminoácidos
- Também conhecido como
- MYO5, GS1, MYR12
- Símbolos anteriores
- MYH12
- Transcrito MANE Select
- ENST00000399233.7NM_001382347.1
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/myo5a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalise MYO5A, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Obter o meu Genome TestRelatório com curadoria relevante para este gene
Síndrome de Griscelli
- Autossómica recessiva
Albinismo parcial com cabelo prateado; o tipo 1 (MYO5A) envolve problemas neurológicos, o tipo 2 (RAB27A) provoca uma hiperativação imunitária potencialmente fatal (HLH), e o tipo 3 (MLPH) afeta apenas a pigmentação.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 4 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
O tipo 2 requer cuidados especializados imediatos e normalmente um transplante de células-tronco.
Como MYO5A está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 12,1 kb dos 221,6 kb do gene; 5643 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de MYO5A
1Fácil
Grau de dificuldade de sequenciar MYO5A com leituras curtas, numa escala de 0 a 100
0 · Fácil100 · Difícil
Quase todos os exões de MYO5A se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.
O que acresce: a proporção dos exões de MYO5A em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTroços onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 100.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.0%
- Partilhado com o chrYAs regiões pseudoautossómicas e a região transposta do X, onde o chrX e o chrY têm a mesma sequência ou uma quase idêntica, pelo que uma leitura de um pode ser posicionada no outro. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.0%
- Cobertura da referênciaLacunas na montagem de referência nas proximidades, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 50.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, em que as leituras escorregam e podem não as abranger. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 30.1,7%
- Conteúdo em GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma deficiente. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 20.1,7%
Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de MYO5A que se encontram nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em zonas onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
4
posições em MYO5A onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
Um genoma completo cobre todos os 221,6 kb de MYO5A, incluindo os intrões, e não apenas os 12,1 kb de exões.
ClinVar pathogenic variants (4)
The MYO5A variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogénica 1
- Provavelmente patogénica 3
| Variante | Conditions | Classificação na ClinVar | Estado de revisão |
|---|---|---|---|
| NM_001382347.1(MYO5A):c.2012+1G>T (opens in a new tab) | Griscelli syndrome type 1 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_001382347.1(MYO5A):c.3043C>T (p.Arg1015Ter) (opens in a new tab) | Griscelli syndrome type 1 | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_001382347.1(MYO5A):c.655C>T (p.Arg219Cys) (opens in a new tab) | Griscelli syndrome type 1 | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_001382347.1(MYO5A):c.274C>T (p.Arg92Cys) (opens in a new tab) | Griscelli syndrome type 1 | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
Genes associados às mesmas condições
Características associadas a MYO5A
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que MYO5A pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Abnormality of the eye
- Double vision
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Noninflammatory retina disease
- Close sighted
- Aplasia/Hypoplasia of the macula
- Cross-eyed
- Macular dystrophy
Mostrar mais 2 características
Abnormality of the integument
- Large clumps of pigment irregularly distributed along hair shaft
- Melanin pigment aggregation in hair shafts
- Silver-gray hair
- Accumulation of melanosomes in melanocytes
- Loss of hair color
- Partial absent skin pigmentation
- Patchy lightened skin
- Premature graying of hair
Mostrar mais 2 características
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicados em 2026-10-19: as condições a que o gene está associado e a força dessa associação.
- A lista de achados secundários do ACMG, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.19-9814e911.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene MYO5A: myosin VA. Consultado em 20 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/myo5a
Dante Labs. Gene MYO5A: myosin VA [Internet]. [consultado em 20 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/myo5a
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