Gen
OTC
ornithine transcarbamylase
- HGNC 8512↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000036473↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 5009↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- Xp11.4
- Współrzędne
- Chromosom X: 38 352 604–38 421 446 (GRCh38)
- Eksony
- 10 eksonów na odcinku 68,8 kb
- Białko
- 354 aminokwasów
- Znany również jako
- OTCase, OTCD, OTC1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000039007.5NM_000531.6
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj OTC oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Zaburzenie cyklu mocznikowego
Genetyczne wrodzone zaburzenie metabolizmu, charakteryzujące się niedoborem jednego z enzymów niezbędnych do cyklu mocznikowego. Prowadzi do nagromadzenia amoniaku w organizmie.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Terapia wychwytywania azotu (benzoesan sodu, glicerolu fenylomaślanu/Ravicti); dieta ograniczona w białko z suplementacją aminokwasów egzogennych; protokoły postępowania awaryjnego w hiperamonemii; przeszczep wątroby (leczenie przyczynowe); badania terapii mRNA w niedoborze OTC; kwas karglumowy w niedoborze NAGS
Budowa genu OTC
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,5 kb z 68,8 kb genu; 1065 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje OTC
182
pozycje w OTC, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 68,8 kb genu OTC, łącznie z intronami, a nie tylko 1,5 kb eksonów.
Warianty z podstroną (49)
Warianty OTC z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A208T | c.622G>A | Ekson 6 | 38 403 699 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| A209V | c.626C>T | Ekson 6 | 38 403 703 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| A233V | c.698C>T | Ekson 7 | 38 408 776 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.3G>A | Ekson 1 | 38 352 699 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.77+1G>A | Intron 1 | 38 352 774 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.298+2T>G | Intron 3 | 38 369 879 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.540+1G>A | Intron 5 | 38 401 429 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.540+265G>A | Intron 5 | 38 401 693 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.663+1G>T | Intron 6 | 38 403 741 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.663+2T>C | Intron 6 | 38 403 742 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ARG1arginase 1Wspólne schorzenie: 1
- ASLargininosuccinate lyaseWspólne schorzenie: 1
- ASS1argininosuccinate synthase 1Wspólne schorzenie: 1
- CA5Acarbonic anhydrase 5AWspólne schorzenie: 1
- CPS1carbamoyl-phosphate synthase 1Wspólne schorzenie: 1
- GLUD1glutamate dehydrogenase 1Wspólne schorzenie: 1
- MCCC1methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1Wspólne schorzenie: 1
- NAGSN-acetylglutamate synthaseWspólne schorzenie: 1
- SLC25A13solute carrier family 25 member 13Wspólne schorzenie: 1
- SLC25A15solute carrier family 25 member 15Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem OTC
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać OTC. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Laboratory abnormality
- High blood ammonia levels
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Elevated circulating uracil concentration
- High urine orotic acid levels
- Low blood sugar
- Decreased circulating citrulline concentration
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen OTC: ornithine transcarbamylase. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/otc
Dante Labs. Gen OTC: ornithine transcarbamylase [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/otc
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni