Gen
CASK
calcium/calmodulin dependent serine protein kinase
- HGNC 1497↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000147044↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 8573↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- Xp11.4
- Koordinater
- Kromosom X: 41 514 934–41 923 554 (GRCh38)
- Eksoner
- 27 eksoner over 408,6 kb
- Protein
- 926 aminosyrer
- Også kjent som
- LIN2, CAGH39, FGS4
- Tidligere symboler
- TNRC8
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000378163.7NM_001367721.1
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les CASK og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Intellektuell funksjonsnedsettelse
Ett av 233 gener knyttet til den
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er CASK bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 8,8 kb av genets 408,6 kb, og 2 781 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test CASK
110
posisjoner i CASK der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 408,6 kb av CASK, inkludert introner, og ikke bare de 8,8 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 tilstand
- ADKadenosine kinaseDeler 1 tilstand
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 tilstand
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 tilstand
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 tilstand
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 tilstand
- ANK3ankyrin 3Deler 1 tilstand
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 tilstand
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 tilstand
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 tilstand
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 tilstand
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til CASK
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene CASK kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Delayed ability to walk
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Hypoplasia of the pons
- Simplified gyral pattern
- Small brainstem
- Small cerebellum
Vis 47 egenskaper til
- Epileptic encephalopathy
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Intellectual disability
- IQ between 34 and 49
- Severe global developmental delay
- Abnormal gait
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed ability to sit
- Difficulty sleeping
- Dystonia
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- Epileptic spasm
- Focal tonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Increased reflexes
- Lethargy
- Myoclonic seizure
- Stereotypical hand wringing
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Fewer and broader ridges in brain
- Generalized clonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Grand mal seizures
- Infantile spasms
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Unsteady walk
- Dilated fourth ventricle
Abnormality of the musculoskeletal system
- Appendicular spasticity
- Decreased muscle tone in infant
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Low muscle tone
- Low muscle tone in trunk
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Poor head control
- Scoliosis
Vis 3 egenskaper til
Abnormality of the eye
- Close sighted
- Cross-eyed
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc pallor
- Visual impairment
- Wide-set eyes
- Hole in the back of the eye
- Optic atrophy
Vis 2 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). CASK-genet: calcium/calmodulin dependent serine protein kinase. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/cask
Dante Labs. CASK-genet: calcium/calmodulin dependent serine protein kinase [Internett]. [sitert 16. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/cask
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker