Gen
CASK
calcium/calmodulin dependent serine protein kinase
- HGNC 1497↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000147044↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 8573↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- Xp11.4
- Koordinater
- Kromosom X: 41.514.934–41.923.554 (GRCh38)
- Exoner
- 27 exoner fordelt over 408,6 kb
- Protein
- 926 aminosyrer
- Også kendt som
- LIN2, CAGH39, FGS4
- Tidligere symboler
- TNRC8
- MANE Select-transkript
- ENST00000378163.7NM_001367721.1
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs CASK og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Intellektuel funktionsnedsættelse
Et af 233 gener, der er knyttet til det
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er CASK opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 8,8 kb af genets 408,6 kb; 2.781 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest CASK
110
positioner i CASK, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 408,6 kb af CASK, inklusive introner, og ikke kun de 8,8 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 sygdom
- ADKadenosine kinaseDeler 1 sygdom
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 sygdom
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 sygdom
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 sygdom
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 sygdom
- ANK3ankyrin 3Deler 1 sygdom
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 sygdom
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 sygdom
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 sygdom
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 sygdom
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 sygdom
Træk knyttet til CASK
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, CASK kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Delayed ability to walk
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Hypoplasia of the pons
- Simplified gyral pattern
- Small brainstem
- Small cerebellum
Vis 47 træk mere
- Epileptic encephalopathy
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Intellectual disability
- IQ between 34 and 49
- Severe global developmental delay
- Abnormal gait
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed ability to sit
- Difficulty sleeping
- Dystonia
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- Epileptic spasm
- Focal tonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Increased reflexes
- Lethargy
- Myoclonic seizure
- Stereotypical hand wringing
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Fewer and broader ridges in brain
- Generalized clonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Grand mal seizures
- Infantile spasms
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Unsteady walk
- Dilated fourth ventricle
Abnormality of the musculoskeletal system
- Appendicular spasticity
- Decreased muscle tone in infant
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Low muscle tone
- Low muscle tone in trunk
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Poor head control
- Scoliosis
Vis 3 træk mere
Abnormality of the eye
- Close sighted
- Cross-eyed
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc pallor
- Visual impairment
- Wide-set eyes
- Hole in the back of the eye
- Optic atrophy
Vis 2 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). CASK-genet: calcium/calmodulin dependent serine protein kinase. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/cask
Dante Labs. CASK-genet: calcium/calmodulin dependent serine protein kinase [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/cask
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger