Gen
SEC61A1
SEC61 translocon subunit alpha 1
- HGNC 18276↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000058262↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 29927↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 3q21.3
- Coördinaten
- Chromosoom 3: 128.052.437–128.071.683 (GRCh38)
- Exons
- 12 exons over 19,2 kb
- Eiwit
- 476 aminozuren
- MANE Select-transcript
- ENST00000243253.8NM_013336.4
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sec61a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SEC61A1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Autosomale dominante tubulointerstitiële nierziekte
- Familiale juveniele hyperurikemische nefropathieAutosomaal dominant
Een dominant overerfelijke tubulointerstitiële nierziekte, meestal veroorzaakt door varianten in UMOD (en ook in REN of SEC61A1), met een verhoogd urinezuurgehalte, vroegtijdig jicht en geleidelijk verlies van nierfunctie.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Het weten hiervan helpt bij het volgen van uw nierfunctie, de behandeling van jicht en een zorgvuldige beoordeling van eventuele levende nierdonoren in uw familie; de REN-vorm kan reageren op fludrocortison.
Common Variable Immunodeficiency (monogene CVID)
- Common variable immunodeficiency
Laag IgG met laag IgA en/of IgM en een slechte reactie op vaccinaties; vormen met één gen omvatten NFKB1, NFKB2, ICOS, CD19, CD81, CR2, IKZF1, IRF2BP2, SEC61A1 en TNFRSF13B (TACI).
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Vervanging met immunoglobulinen en vroege behandeling van infecties zijn standaard. Een genetische oorzaak kan u helpen bij de controle op auto-immuniteit, lymfoom en longziekte, en sommige vormen (zoals LRBA-deficiëntie) reageren op gerichte therapie.
Bredere groeperingen
Overige aangeboren immuunstoornissen
- Aangeboren immuundeficiëntie
Een van 114 genen die hiermee verband houden
Erfelijke aandoeningen van het immuunsysteem die worden veroorzaakt door veranderingen in één gen en die invloed hebben op hoe het lichaam infecties bestrijdt of ontstekingen reguleert.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
- Immuundeficiëntieziekte
Een van 170 genen die hiermee verband houden
Ziekte waarbij er een tekort of defect is in de mechanismen van de immuniteit, zowel cellulair als humoraal.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
HSCT bij SCID en ernstige PID's; immunoglobulinevervangende therapie (IVIG/SCIG) bij antilichaamdeficiënties; leniolisib (Joenja, FDA 2023) bij APDS; genetherapie bij ADA-SCID; abatacept bij CTLA4- of LRBA-deficiëntie; profylactische antibiotica; G-CSF bij CGD
Opbouw van SEC61A1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,6 kb van de 19,2 kb van het gen; 1.431 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SEC61A1
3
posities in SEC61A1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 19,2 kb van SEC61A1, inclusief intronen, en niet alleen de 3,6 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- CD19CD19 moleculeDeelt 3 aandoeningen
- CR2complement C3d receptor 2Deelt 3 aandoeningen
- ICOSinducible T cell costimulatorDeelt 3 aandoeningen
- IKZF1IKAROS family zinc finger 1Deelt 3 aandoeningen
- IRF2BP2interferon regulatory factor 2 binding protein 2Deelt 3 aandoeningen
- LRBALPS responsive beige-like anchor proteinDeelt 3 aandoeningen
- NFKB1nuclear factor kappa B subunit 1Deelt 3 aandoeningen
- NFKB2nuclear factor kappa B subunit 2Deelt 3 aandoeningen
- TNFRSF13BTNF receptor superfamily member 13BDeelt 3 aandoeningen
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDeelt 2 aandoeningen
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deelt 2 aandoeningen
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDeelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan SEC61A1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SEC61A1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the immune system
- Decreased specific antibody response to unconjugated polysaccharide vaccine
- Infection in blood stream
- Pneumonia
- Recurrent chest infections
- Recurrent cutaneous abscess formation
- Decreased specific antibody response to protein-conjugated polysaccharide vaccine
- Partial absence of specific antibody response to tetanus vaccine
- Recurrent infections
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SEC61A1-gen: SEC61 translocon subunit alpha 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/sec61a1
Dante Labs. SEC61A1-gen: SEC61 translocon subunit alpha 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/sec61a1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken