Gén
PIGY
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Y
- HGNC 28213↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000255072↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 84992↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 4q22.1
- Koordináták
- 4. kromoszóma: 88 520 998–88 523 776 (GRCh38)
- Exonok
- 2 exon, összesen 2,8 kb
- Fehérje
- 71 aminosav
- Más néven ismert
- MGC14156, PIG-Y
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000527353.2NM_001042616.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pigy.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a PIGY-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
GPI Anchor Biosynthesis Defects
- Hyperphosphatasia With Impaired Intellectual Development (Mabry Syndrome)Autoszomális recesszív
A group of GPI anchor defects (PIGV, PIGO, PGAP2, PGAP3, PIGW, PIGY) in which a persistently high alkaline phosphatase accompanies developmental delay, seizures and short end bones of the fingers.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Some affected children have had seizure control improved with pyridoxine (vitamin B6), so a diagnosis can guide a specialist trial of treatment.
- Disorders of GPI Anchor Biosynthesis
A group of inherited conditions caused by variants in the PIG, PGAP and related genes needed to make and attach the GPI anchor, typically causing developmental delay, low muscle tone and epilepsy.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Congenital Disorders of Glycosylation
- Congenital Disorders of Glycosylation (CDG)
A 98 hozzá kapcsolódó gén egyike
A large group of inherited conditions in which sugar chains (glycans) are not correctly built or attached to proteins and lipids, often affecting the brain, liver, blood clotting, growth and many other body systems. Most are autosomal recessive, but some are X-linked or autosomal dominant.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A PIGY felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 2,8 kb-jából 1,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 216 bázis kódolja a fehérjét.
PIGY szekvenálása
61Nehéz
Mennyire nehéz a PIGY szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A PIGY nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.
Ami tovább nehezíti: a PIGY exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.2,7%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.96%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.2%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.21%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a PIGY exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- PGAP2post-GPI attachment to proteins 23 betegséget oszt meg
- PGAP3post-GPI attachment to proteins phospholipase 33 betegséget oszt meg
- PIGOphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class O3 betegséget oszt meg
- PIGVphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V3 betegséget oszt meg
- PIGWphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class W3 betegséget oszt meg
- PIGAphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class A2 betegséget oszt meg
- PIGGphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G (EMM blood group)2 betegséget oszt meg
- PIGLphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class L2 betegséget oszt meg
- PIGNphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N2 betegséget oszt meg
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class T2 betegséget oszt meg
- ST3GAL5ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 52 betegséget oszt meg
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)1 betegséget oszt meg
A(z) PIGY génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PIGY gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of head or neck
- Depressed nasal bridge
- High palate
- Narrow forehead
- Nasal tip, upturned
- Abnormal facial shape
- Broad opening between the eyelids
- Downturned corners of mouth
- Short neck
Még 19 tulajdonság megjelenítése
- Tented mouth
- Wide nasal bridge
- Abnormal parietal bone morphology
- Asymmetry of the posterior head
- Bifid uvula
- Big lower jaw
- Broad head shape
- Broad philtrum
- Bulbous nose
- Coarse facial features
- Decreased head circumference
- Eye folds
- Highly arched eyebrow
- Increased head circumference
- Little lower jaw
- Prominent nasal bridge
- Round face
- Short philtrum
- Upward slanting of the opening between the eyelids
Abnormality of limbs
- Hip contracture
- Shortening of all outermost bones of the fingers
- Webbed 2nd and 3rd toes
- Curvature of little finger
- Elbow flexion contracture
- Fused toes
- Inability to straighten knee
- Inward turned thumb
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the eye
- Cerebral visual impairment
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Deeply set eye
- Wide-set eyes
- Visual impairment
- Farsightedness
- Inward turning cross eyed
- Oculomotor apraxia
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PIGY gén: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Y. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pigy
Dante Labs. PIGY gén: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Y [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pigy
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt