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Gène

FOXP1

forkhead box P1

Résumé

Localisation cytogénétique
3p13
Coordonnées
Chromosome 3 : 70 954 708–71 583 728 (GRCh38)
Exons
21 exons sur 629 kb
Protéine
677 acides aminés
Aussi appelé
QRF1, 12CC4, HSPC215, hFKH1B
Transcrit MANE Select
ENST00000649528.3NM_001349338.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    • Déficience intellectuelle

      • L'un des 233 gènes qui lui sont liés

        • ClinGen classe ce lien comme définitif
        • 5 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort

    Structure de FOXP1

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de FOXP1. FOXP1 et 4 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 70 325 687 à 72 212 749.Chromosome 33p13p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2970,5 Mb71 Mb71,5 Mb72 MbFOXP1 : 70 954 708–71 583 728, brin inverseFOXP1 : 70 959 226–71 754 229, brin inverseEIF4E3 : 71 675 414–71 754 773, brin inverseEIF4E3GPR27 : 71 753 855–71 756 496, brin directGPR27PROK2 : 71 770 940–71 785 419, brin inversePROK2Schéma de FOXP1 : 21 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 21 : 1 site connu associé à une maladieExon 20 : 3 sites connus associés à une maladieExon 19 : 3 sites connus associés à une maladieExon 18 : 15 sites connus associés à une maladieExon 17 : 10 sites connus associés à une maladieExon 16 : 9 sites connus associés à une maladieExon 15 : 14 sites connus associés à une maladieExon 14 : 3 sites connus associés à une maladieExon 13 : 3 sites connus associés à une maladieExon 12 : 4 sites connus associés à une maladieExon 11 : 5 sites connus associés à une maladieExon 10 : 6 sites connus associés à une maladieExon 9 : 6 sites connus associés à une maladieExon 8 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 21 : 70 954 708–70 959 391, 4 684 basesExon 20 : 70 965 890–70 966 056, 167 basesExon 19 : 70 970 736–70 970 805, 70 basesExon 18 : 70 972 555–70 972 676, 122 basesExon 17 : 70 976 941–70 977 042, 102 basesExon 16 : 70 977 643–70 977 722, 80 basesExon 15 : 70 977 828–70 978 029, 202 basesExon 14 : 70 987 994–70 988 077, 84 basesExon 13 : 71 000 972–71 001 059, 88 basesExon 12 : 71 015 549–71 015 653, 105 basesExon 11 : 71 041 328–71 041 532, 205 basesExon 10 : 71 046 942–71 047 095, 154 basesExon 9 : 71 052 537–71 052 626, 90 basesExon 8 : 71 053 636–71 053 773, 138 basesExon 7 : 71 112 536–71 112 637, 102 basesExon 6 : 71 198 202–71 198 392, 191 basesExon 5 : 71 299 820–71 299 880, 61 basesExon 4 : 71 359 150–71 359 244, 95 basesExon 3 : 71 493 426–71 493 555, 130 basesExon 2 : 71 581 549–71 581 697, 149 basesExon 1 : 71 583 571–71 583 728, 158 bases2115′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 7,2 kb sur les 629 kb du gène ; 2 034 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit FOXP1

    103

    positions dans FOXP1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

    Un génome entier couvre les 629 kb de FOXP1, introns compris, et pas seulement les 7,2 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène FOXP1 : forkhead box P1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/foxp1

    Vancouver

    Dante Labs. Gène FOXP1 : forkhead box P1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/foxp1

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