Gén
FOXP1
forkhead box P1
- HGNC 3823↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000114861↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 27086↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 3p13
- Koordináták
- 3. kromoszóma: 70 954 708–71 583 728 (GRCh38)
- Exonok
- 21 exon, összesen 629 kb
- Fehérje
- 677 aminosav
- Más néven ismert
- QRF1, 12CC4, HSPC215, hFKH1B
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000649528.3NM_001349338.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/foxp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a FOXP1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Intellectual Disability
A 233 hozzá kapcsolódó gén egyike
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A FOXP1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 629 kb-jából 7,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2034 bázis kódolja a fehérjét.
FOXP1 szekvenálása
103
a FOXP1 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a FOXP1 mind a 629 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 7,2 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (113)
The FOXP1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 60
- Patogén/valószínűleg patogén 4
- Valószínűleg patogén 49
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1574G>A (p.Arg525Gln) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1573C>T (p.Arg525Ter) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1540C>T (p.Arg514Cys) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1507C>T (p.Arg503Ter) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1409A>T (p.Tyr470Phe) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1317C>G (p.Tyr439Ter) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1146+1G>A (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.844_845del (p.Val283fs) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1652+5G>A (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1541G>A (p.Arg514His) (opens in a new tab) | intellectual disability and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1426_1428+1del (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1240_1241del (p.Leu414fs) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1475A>G (p.Tyr492Cys) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1429-1G>A (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.2018del (p.Asn673fs) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1790_1794dup (p.Ala599delinsThrTer) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1750_1751dup (p.Thr587fs) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1718_1722+8del (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1684del (p.Ser562fs) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1653_1669del (p.Asn552fs) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1653-1G>A (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1653-2A>T (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1653-2A>G (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1630C>T (p.Arg544Ter) (opens in a new tab) | intellectual disability | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001349338.3(FOXP1):c.1590del (p.Ala532fs) (opens in a new tab) | intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
See all 113 with every other FOXP1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 41 betegséget oszt meg
- ADKadenosine kinase1 betegséget oszt meg
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeobox1 betegséget oszt meg
- AFF2ALF transcription elongation factor 21 betegséget oszt meg
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 11 betegséget oszt meg
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferase1 betegséget oszt meg
- ANK3ankyrin 31 betegséget oszt meg
- ANKRD11ankyrin repeat domain 111 betegséget oszt meg
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 21 betegséget oszt meg
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 11 betegséget oszt meg
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 91 betegséget oszt meg
- ARID1AAT-rich interaction domain 1A1 betegséget oszt meg
A(z) FOXP1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) FOXP1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Delayed ability to walk
- Delayed CNS myelination
- Delayed motor skills
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Inflexible adherence to routines
Még 21 tulajdonság megjelenítése
- Intellectual disability
- Language impairment
- Motor delay
- Obsessive compulsive behavior
- Repetitive movements
- Self-injurious behavior
- Communication delay
- Speech articulation difficulties
- Attention deficit
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
- Oromotor apraxia
- Repetitive compulsive behavior
- Short attention span
- Speech apraxia
- EEG abnormality
- Epilepsy
- Intellectual disability, mild
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-18 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-8b139e39.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). FOXP1 gén: forkhead box P1. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/foxp1
Dante Labs. FOXP1 gén: forkhead box P1 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/foxp1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt